Hiện có 1,6 triệu người Afghanistan ở Pakistan, quy chế cho những người này sẽ hết hạn vào ngày 30/6/2013. Trong những năm 1980, Pakistan cũng là nơi tiếp nhận những người tị nạn Afghnistan đến lánh nạn khỏi cuộc chiến ở đất nước mình.
Sau năm 1991, nhiều ý kiến của tại Pakistan muốn hồi hương người tị nạn Afghanistan, tuy nhiên chính quyền Pakistan cho biết họ sẽ không buộc người tị nạn phải rời đi.
Theo quy chế mới, người tị nạn Afghanistan sẽ được chính phủ Pakistan cấp thẻ ID mới và có thể sử dụng thẻ này trong các hoạt động hàng ngày như dịch vụ ngân hàng, hay đăng ký đi học.
Tháng 8/2012, một báo cáo của Liên Hợp Quốc cho biết Afghanistan và Iraq là hai quốc gia có số người tị nạn rời bỏ đất nước ra đi nhiều nhất thế giới