Quy chế nêu rõ, Ủy ban làm việc theo nguyên tắc dân chủ, công khai và do Chủ tịch Ủy ban quyết định. Các thành viên Ủy ban chủ động giải quyết công việc trong quá trình thực hiện các nhiệm vụ thúc đẩy tiến trình chuyển đổi số quốc gia, gắn kết chặt chẽ với cải cách hành chính; xây dựng, phát triển Chính phủ điện tử, Chính phủ số, kinh tế số, xã hội số và đô thị thông minh; tạo thuận lợi cho việc triển khai Cách mạng công nghiệp lần thứ tư tại Việt Nam; bảo đảm yêu cầu phối hợp công tác, trao đổi thông tin trong giải quyết công việc theo chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn được giao.
Ủy ban có thể làm việc theo các hình thức như tổ chức phiên họp định kỳ, cuộc họp đột xuất, tổ chức hội nghị, hội thảo hoặc cho ý kiến bằng văn bản. Ủy ban họp định kỳ 1 quý/lần, sơ kết 6 tháng; họp tổng kết cuối năm với Ban Chỉ đạo chuyển đổi số của các bộ, ngành, địa phương hoặc đột xuất theo triệu tập của Chủ tịch Ủy ban.
Quy chế cũng quy định rõ nhiệm vụ, quyền hạn của Chủ tịch, các Phó Chủ tịch, các Ủy viên và Tổ công tác giúp việc của Ủy ban Quốc gia về chuyển đổi số.
Thủ tướng phê duyệt thành viên Ủy ban Quốc gia về Chính phủ điện tử 
