Tác giả của tội ác man rợ và vô nhân tính này được cho là của nhóm khủng bố Al Qaeda. Giận dữ và đau thương trước sự mất mát quá lớn, những người Cơ Đốc giáo Ai Cập đã tụ tập và đụng độ với cảnh sát, ném đá và chai lọ vào các nhân viên an ninh, hô hào những khẩu hiệu chống chính phủ ở bên ngoài nhà thờ trên. Một số người biểu tình còn đánh những người Hồi giáo qua đường khiến lực lượng an ninh phải dùng hơi cay và đạn cao su để giải tán đám đông.
Thời gian qua, các chuyên gia quốc tế nhận xét rằng, tại Ai Cập có sự gia tăng căng thẳng giữa người Hồi giáo và Cơ Đốc giáo. Từ lâu, tại quốc gia này tồn tại các trung tâm của phong trào Hồi giáo cực đoan và trong những năm gần đây, phong trào này trở nên mạnh hơn. Hiện tại, những người Hồi giáo cực đoan lợi dụng cuộc khủng hoảng kinh tế để làm suy yếu vị thế của chính phủ.
Thông qua những cuộc tấn công khủng bố như thế, họ tìm cách đẩy các tôn giáo khác nhau vào các cuộc xung đột đẫm máu, đe dọa an ninh xã hội khiến cho quốc gia nằm trong trạng thái mất ổn định để từ đó lật đổ chính quyền và nắm lấy vai trò lãnh đạo cho người theo đạo Hồi một cách vĩnh viễn.
Giáo hội chính thống Copte tại Ai Cập chiếm 10% trên tổng số 80 triệu dân Ai Cập và từ lâu họ đã trở thành mục tiêu đe dọa bởi các nhóm Hồi giáo quá khích. Nhưng tấn công trực diện vào cộng đồng này như những gì đã xảy ra trong ngày 1/1 vừa qua là vụ tấn công bạo lực đẫm máu nhất nhằm vào cộng đồng người Cơ Đốc giáo sống ở Ai Cập trong vòng một thập kỷ qua.
Điều này cho thấy, kẻ khủng bố gây đổ máu và có chủ ý tại Alexandria - "pháo đài" của người Hồi giáo có rất nhiều tư tưởng cực đoan và cũng là nơi có cộng đồng Cơ Đốc giáo lớn nhất tại Trung Đông - để phát đi thông điệp về một cuộc chiến chống các tín đồ Kitô và người Công giáo đang sống tại khu vực này...
Trước tình hình trên, các chính trị gia và lãnh đạo tôn giáo đã lên án các cuộc tấn công và kêu gọi người dân hết sức bình tĩnh nhằm tránh làm bùng phát đụng độ giữa các Kitô hữu và người Hồi giáo như những gì kẻ thù của hai đạo giáo này mong muốn. Giáo hoàng Benedict XVI đã kêu gọi các nhà lãnh đạo trên thế giới bảo vệ những người Cơ Đốc giáo sau vụ khủng bố trên.
Về phần mình, Tổng thống Ai Cập Hosni Moubarak đã lên án tội ác man rợ trên nhằm vào người dân Ai Cập nói chung mà không phân biệt tôn giáo. Tổng thống kêu gọi người Cơ Đốc giáo và Hồi giáo sát cánh bên nhau trong cuộc chiến chống lại kẻ thù chung của dân tộc và đồng thời cam kết sẽ chiến đấu để tiêu diệt tận gốc chủ nghĩa khủng bố.
Người đứng đầu Tổ chức Hội nghị Hồi giáo (OIC), ông Ekmeleddin Ihsanoglu, kêu gọi người dân Ai Cập tránh các âm mưu xúi giục nổi loạn hoặc gây chia rẽ lẫn nhau. Tổng thống Mỹ Barack Obama cũng lên án mạnh mẽ "hành động dã man và vô đạo đức" của những kẻ thực hiện vụ tấn công trên. Ông bày tỏ mong muốn những kẻ gây ra vụ tấn công phải bị xét xử; đồng thời khẳng định Mỹ sẵn sàng hỗ trợ Chính phủ Ai Cập giải quyết vụ việc này...
Ngày 4/1, bà Nguyễn Phương Nga, Người phát ngôn Bộ Ngoại giao Việt Nam, tuyên bố: "Việt Nam lên án mạnh mẽ vụ đánh bom khủng bố nhà thờ Thiên Chúa giáo Al-Qiddisain tại thành phố Alexandria, Ai Cập và gửi lời chia buồn sâu sắc tới Chính phủ Ai Cập cùng gia quyến các nạn nhân và cho rằng, những kẻ khủng bố cần phải bị trừng trị thích đáng". Vấn đề quan trọng nhất là các tôn giáo, cả loài người hơn lúc nào hết cần phải tỉnh táo, không mắc mưu những kẻ đứng trong bóng tối để kích động nên cảnh "nồi da nấu thịt"