Mới đây các nhà khoa học đã phát hiện dấu vết của hai dòng người cổ đại chưa từng được biết đến, dù chưa tìm thấy hóa thạch hay DNA trực tiếp của họ. Manh mối này được lưu giữ trong bộ gene của con người ngày nay. Phương pháp có tên TRACE, truy ngược nguồn gốc các đoạn DNA trong bộ gene người hiện đại để tái dựng những nhánh đã thất lạc của cây tiến hóa loài người. Một dòng tổ tiên được cho là từng giao phối trực tiếp với Homo sapiens tại châu Phi hơn 50.000 năm trước, trước khi người hiện đại di cư khỏi châu lục này.
Ước tính DNA có nguồn gốc từ dòng người bí ẩn chiếm khoảng 0,5-1% bộ gene của con người ngày nay. Dòng thứ hai cổ xưa hơn nhiều. Nhóm người này được cho là đã giao phối với người Denisovan tại khu vực Á - Âu hơn 200.000 năm trước, sau đó một phần DNA được truyền sang Homo sapiens thông qua người Denisovan. Trước đây, các nghiên cứu đã phát hiện dấu vết của những dòng người “ma” trong DNA người hiện đại, nhưng chưa xác định mức độ xa xưa của các nhóm này. Việc xác định các nguồn gene cổ đại giải thích vì sao một số nhóm người đã biến mất, nhưng dấu vết di truyền của họ vẫn tồn tại tới ngày nay.