Đã phối hợp với các tỉnh, thành phố khám nghiệm hiện trường, thực nghiệm điều tra... Cùng với Công an TP Hồ Chí Minh thực nghiệm làm rõ vụ nổ tại khách sạn Caravelle, số 19 Công trường Lam Sơn quận 1; khám nghiệm vụ TNGT nghiêm trọng tại Đèo Đại Ninh làm chết 10 người, trong đó có 9 nạn nhân là người nước ngoài; vụ sập cầu treo tại công trình xây dựng cầu Trà Ôn, tỉnh Vĩnh Long làm 5 người tử vong; khám nghiệm và xác định nguyên nhân cháy xảy ra tại Công ty TNHH Omexey Home Furnishing Việt Nam tại xã Tân Hiệp, huyện Tân Uyên, tỉnh Bình Dương làm thiệt hại khoảng 13,6 tỉ đồng… giám định 4.835 vụ thuộc các lĩnh vực Hóa-Lý; Công cụ-Súng đạn; Giám định kỹ thuật pháp lý… đều cho kết quả nhanh, giúp cho công tác điều tra kịp thời đấu tranh khám phá án.
Ngoài công tác chuyên môn, qua nghiên cứu, Phân viện Khoa học hình sự tại TP Hồ Chí Minh còn ứng dụng khoa học công nghệ tiên tiến đưa vào sử dụng, phục vụ thiết thực đối với công tác phòng, chống tội phạm.
Năm 2010, Phân viện Khoa học hình sự tại TP Hồ Chí Minh sẽ hoàn thiện "Tàng thư gien tội phạm quốc gia", phục vụ lâu dài cho công tác điều tra truy bắt tội phạm. Bên cạnh công tác chuyên môn nghiệp vụ, Phân viện còn tổ chức mở lớp tập huấn nghiệp vụ giám định dấu vết đường vân theo kế hoạch của Viện Khoa học hình sự.
Phối hợp cùng Công an tỉnh Vĩnh Long, TP Hồ Chí Minh, Cần Thơ, Tiền Giang, Đồng Tháp, Tây Ninh, Kiên Giang… tổ chức giảng dạy lớp tập huấn nghiệp vụ khoa học hình sự cho Công an cấp huyện với quyết tâm thực hiện thành công Đề án hiện đại hóa công tác kỹ thuật hình sự theo chỉ đạo của Đảng ủy Công an TW và lãnh đạo Bộ Công an.
Ngoài ra, còn tham gia giảng dạy tại các Trường Đại học CSND, Đại học ANND, Viện Pháp y Quốc gia tạo tiền đề cho lực lượng làm công tác giám định thực hiện tốt Đề án đổi mới và nâng cao hiệu quả hoạt động giám định tư pháp khi được Thủ tướng phê duyệt