Nguyên nhân dẫn đến tình trạng trên là do Thông tư số 92/2015/TT-BTC quy định trường hợp trên hợp đồng chuyển nhượng quyền sử dụng đất không ghi giá hoặc giá trên hợp đồng chuyển nhượng thấp hơn giá đất do UBND cấp tỉnh quy định thì giá chuyển nhượng được xác định theo bảng giá đất do UBND tỉnh quy định tại thời điểm chuyển nhượng. Trong khi đó, UBND TP Hồ Chí Minh chưa ban hành được bảng giá đất điều chỉnh nên cơ quan thuế không giải quyết đối với hàng nghìn trường hợp này.
Để đảm bảo quyền lợi cho người dân, doanh nghiệp, Hiệp hội Bất động sản (BĐS) TP Hồ Chí Minh đã đề xuất giải pháp phân loại hồ sơ để xử lý. Trong đó, Cục Thuế thành phố cần chỉ đạo các Chi cục thuế giải quyết ngay 2.737 hồ sơ thuộc các trường hợp không phát sinh nghĩa vụ tài chính đối với Nhà nước như không phát sinh nghĩa vụ thuế thu nhập cá nhân từ chuyển nhượng BĐS, lệ phí trước bạ…
Đối với 5.448 hồ sơ còn lại, Hiệp hội BĐS cho rằng Bộ Tài chính cần có hướng dẫn nghiệp vụ để xử lý. Trong đó, 346 hồ sơ thu tiền sử dụng đất khi công nhận QSDĐ và 277 hồ sơ thu tiền sử dụng đất khi chuyển mục đích, cần điều chỉnh hệ số điều chỉnh giá đất theo quy định của Luật Đất đai 2013 cùng lúc với bảng giá đất do UBND cấp tỉnh ban hành theo quy định của Luật Đất đai 2013 đang được tiếp tục áp dụng đến hết ngày 31/12/2025 để giải quyết.
Nhằm góp phần tháo gỡ vướng mắc trong việc ban hành bảng giá đất theo Luật Đất đai 2024 của TP Hồ Chí Minh, ngày 6/9 vừa qua, Bộ Tài nguyên và Môi trường đã mời Ủy ban Kinh tế, Ủy ban Tư pháp của Quốc hội; Văn phòng Chính phủ, Bộ Tài chính, Bộ Tư pháp, Bộ Xây dựng, Bộ Kế hoạch và Đầu tư, UBND TP Hồ Chí Minh và Hiệp hội BĐS thành phố họp trong ngày 10/9 để lấy ý kiến, trao đổi các vấn đề vướng mắc, thống nhất phương án để báo cáo Thủ tướng Chính phủ. Trước đó, ngày 29/8 vừa qua, Bộ Tài nguyên và Môi trường cũng đã có văn bản gửi các cơ quan nghiên cứu, góp ý kiến về vấn đề vướng mắc trong áp dụng bảng giá đất của TP Hồ Chí Minh.
Chỉ 25% số trường hợp tồn đọng tại Hà Nội và TP Hồ Chí Minh có thể được cấp sổ đỏ 
