Theo kết quả điều tra, Công ty TNHH Huy Vũ do Nguyễn Văn Huy làm giám đốc, có trụ sở tại số 679/10 Nguyễn Kiệm, phường 3, quận Phú Nhuận, TP Hồ Chí Minh. Vào ngày 16/1/2012, Nguyễn Văn Huy ký tờ khai hải quan điện tử số 1320 xuất khẩu sang Công ty Ruvimex LTD của Ukraina 96.000 áo thun xuất khẩu do Việt Nam sản xuất, trị giá 86.400 USD, thanh toán TTR, xếp hàng tại cảng Sài Gòn khu vực 4, được hệ thống thông quan điện tử phân vào luồng xanh (hàng miễn kiểm tra). Các nhân viên Hải quan điện tử nghi ngờ nên kiểm tra toàn bộ số hàng trên, phát hiện 19 lóng gỗ xẻ hộp loại gỗ quý giáng hương và lập biên bản vi phạm.
Theo Nguyễn Văn Huy khai nhận: tờ khai Hải quan điện tử trên do nhận làm thủ tục xuất khẩu cho Công ty TNHH Tân Hồng Phước. Khi xác minh địa chỉ Công ty Tân Hồng Phước, cơ quan thuế quận Tân Bình cho biết, công ty này đã bỏ địa chỉ kinh doanh từ lâu.
Từ đầu năm 2012, Đội Giám sát thuộc Chi cục Hải quan cửa khẩu Tân Cảng kiểm tra phát hiện 2 container hàng xuất khẩu của Công ty TNHH SX-TM-DV Hưng Nghiệp khai Hải quan điện tử là hàng may mặc XK đi Trung Quốc. Nhưng khi Hải quan kiểm tra thì toàn bộ là gỗ quý xẻ hộp. Hải quan TP Hồ Chí Minh tiến hành kiểm tra tất cả các lô hàng xuất khẩu khai hàng may mặc của hai Công ty Huy Vũ và Hưng Nghiệp đang nằm tại bãi Hải quan chờ thông quan luồng xanh thì phát hiện: Công ty Hưng Nghiệp do ông Phạm Bá Nghiệp làm giám đốc ký tất cả 7 tờ khai Hải quan điện tử đã hoàn tất thủ tục Hải quan xuất khẩu tại các cảng Sài Gòn khu vực 4, cảng Tân Cảng và cảng Cát Lái, tổng cộng 14 container. Công ty Huy Vũ ký 2 tờ khai Hải quan điện tử với 2 container đã hoàn tất thủ tục XK tại Cảng Sài Gòn khu vực 4.
Như vậy trong số 16 container do Công ty Huy Vũ và Công ty Hưng Nghiệp khai gian dối khi làm thủ tục thông quan Hải quan điện tử phân luồng xanh, chỉ có 1 container là chứa hàng may mặc xuất khẩu, còn lại 15 container chứa 344,623m3 gỗ giáng hương, thuộc nhóm gỗ quý cấm khai thác.
Cơ quan điều tra cũng đã trưng cầu giám định tại Hội đồng định giá tài sản, kết quả số hàng buôn lậu gỗ giáng hương tổng trị giá là 17.597.132.500 đồng. Đây là vụ án buôn lậu với số lượng hàng hóa đặc biệt lớn gồm 15 container xuất khẩu đi Nga, Trung Quốc và Ukraina do Nguyễn Văn Huy cầm đầu tổ chức thực hiện. Huy đã lợi dụng chính sách nhà nước khuyến khích ưu tiên trong xuất khẩu mặt hàng may mặc, được phân luồng xanh miễn kiểm tra, đồng thời lợi dụng tư cách pháp nhân của Công ty Hưng Nghiệp, làm phí ủy thác xuất khẩu hàng bằng cách ký khống các tờ khai hải quan điện tử, giấy giới thiệu để Huy làm thủ tục Hải quan xuất hàng không phải hàng may mặc mà là gỗ quý
