Để có thể ổn định được thị trường xuất khẩu, các chuyên gia ngành thuỷ sản khuyến cáo, trước mắt, các doanh nghiệp cần chuyển hướng thị trường tiêu thụ vào các nước chưa có yêu cầu về chứng nhận thuỷ sản khai thác như: Nhật Bản, Thái Lan, Hàn Quốc, Canada... Mặt khác, doanh nghiệp cần tích cực hỗ trợ, hướng dẫn ngư dân trong việc ghi nhật ký khai thác thuỷ sản.
Theo quy chế Chứng nhận thuỷ sản khai thác xuất khẩu vào thị trường châu Âu, chủ tàu khai thác hải sản phải ghi đầy đủ các hạng mục trong Sổ nhật ký khai thác thuỷ sản. Bên cạnh đó, theo quy chế, các công ty chế biến thuỷ sản xuất khẩu phải đăng ký xác nhận thuỷ sản khai thác đối với các lô sản phẩm được chế biến từ nguyên liệu thu mua.
Để làm đúng các quy trình thủ tục và được xác nhận của Cục Quản lý chất lượng nông, lâm sản và thuỷ sản, các công ty chế biến thuỷ sản phải kê khai đầy đủ, nhiều hạng mục. Trong đó, các công ty phải kê khai khối lượng thuỷ sản khai thác.
Theo đại diện một số công ty chế biến, hiện nay, các công ty có hàng xuất khẩu sang EU đang gặp khó khăn từ các khách hàng vì khách hàng EU đang chờ tín hiệu từ phía đối tác Việt Nam trong việc thông tin đầy đủ về việc thực hiện quy định chứng nhận nguồn gốc thuỷ sản