Virus H5N1 lưu hành trên địa bàn tỉnh Bà Rịa - Vũng Tàu thuộc nhánh 2.3.2.1.C (được xác định có độc lực cao, có khả năng biến thể kháng lại vaccin). Như vậy, hiện nay, cả nước còn 78 ổ dịch cúm gia cầm H5N1 tại 21 tỉnh. Toàn bộ số gia cầm trong đàn mắc bệnh đã được địa phương tiêu huỷ.
Về nhánh virus cúm gia cầm mới này, Cục Thú y nhận định, cuối năm 2013 và đầu năm 2014, nhánh virus 2.3.2.1C đã xâm nhập vào các tỉnh phía Nam và gây bệnh thay cho nhánh 1.1 lưu hành phổ biến tại các tỉnh phía Nam trong những năm trước đây. Nguyên nhân có thể do quá trình vận chuyển gia cầm từ phía Bắc vào Nam, sau đó lây lan qua các đàn vịt chạy đồng trong vùng dẫn đến việc nhánh 2.3.2.1C xuất hiện và lưu hành rộng rãi tại các tỉnh phía Nam đặc biệt là vùng Đồng bằng sông Cửu Long.
Một điều đáng lưu ý là, do nhánh 2.3.2.1C mới xuất hiện nên một số hộ dân ở Cần Thơ do không nắm được đã tiêm phòng vaccin H5N1 cho đàn gia cầm nhưng gia cầm vẫn bị chết và kết quả kiểm nghiệm mẫu bệnh phẩm cho thấy dương tính với virus H5N1. Chuyên gia của Cục Thú y cho hay, nhánh virus 2.3.2.1C không phải là nhánh virus hoàn toàn mới và vẫn có vaccin phòng dịch. Cụ thể, qua thử nghiệm của Cục, vaccin H5N1 Re-6 đạt tỷ lệ bảo hộ 100% đối với virus H5N1 trên vịt nhánh 1.1; nhánh 2.3.2.1A, nhánh 2.3.2.1B và nhánh 2.3.2.1C
Trong đợt dịch vừa qua, Cục Thú y cấp 7,2/38 triệu liều vaccin trong quỹ dự phòng giúp 6 tỉnh có công bố dịch tiêm cho gia cầm để bao vây, ngăn dập dịch. Cục cũng đã đề xuất mua thêm 60 triệu liều vaccin dự phòng, chống dịch cúm gia cầm. Một điều đáng lưu ý, Cục Thú y dẫn quy định của Bộ Tài chính cho hay, nguồn vaccin của Trung ương chỉ hỗ trợ các địa phương tiêm phòng bao vây khẩn cấp các ổ dịch khi UBND tỉnh công bố dịch và có đề nghị cấp vaccin. Ngoài ra, các địa phương phải chủ động sử dụng ngân sách địa phương mua vaccin phòng chống dịch. Hiện nay, trên thị trường vẫn còn nhiều vaccin Re-6 để cung cấp cho các tỉnh, thành