Qua 5 năm phối hợp (từ ngày 31/10/2007 đến nay), cơ quan Thuế đã chuyển 1.486 hồ sơ có dấu hiệu vi phạm về lĩnh vực thuế và cung cấp 2.142 thông tin cho Công an. Các hành vi vi phạm chủ yếu gồm: doanh nghiệp (DN) bỏ trốn, bỏ địa chỉ kinh doanh, mang theo hóa đơn; mua bán hóa đơn bất hợp pháp để kê khai khấu trừ thuế; ghi hóa đơn không đúng quy định; sử dụng chứng từ nộp tiền giả; trốn thuế, kinh doanh trái phép, sai chức năng; sử dụng giấy tờ giả để thành lập công ty, ẩn lậu doanh thu; Hành vi lừa đảo bằng hình thức huy động vốn…
Cũng trong 5 năm qua, Công an TP Hồ Chí Minh đã thụ lý điều tra tổng cộng 640 vụ vi phạm pháp luật về thuế. Trong đó, khởi tố hình sự 86 vụ, xử lý vi phạm hành chính 124 vụ và chuyển cơ quan khác để xử lý theo thẩm quyền (xử phạt, truy thu thuế…) 394 vụ. Hiện còn 36 vụ đang điều tra. Tổng số tiền thuế đề nghị truy thu, xử phạt, nộp ngân sách Nhà nước hơn 228,5 tỷ đồng.
Cơ quan CSĐT đã kết luận điều tra, đề nghị truy tố 55 vụ án gồm 139 bị can với các tội danh: Trốn thuế; lừa đảo chiếm đoạt tài sản thông qua hoàn thuế; lưu hành giấy tờ có giá giả khác; in, phát hành, mua bán trái phép hóa đơn, chứng từ; mặc dù số lượng hồ sơ được chuyển từ cơ quan Thuế chuyển sang cơ quan Công an khá nhiều nhưng việc xử lý của cơ quan Công an còn ít là do nhiều hồ sơ chưa đủ căn cứ pháp lý để truy tố.
Tội phạm trong lĩnh vực thuế, đặc biệt là tình hình mua bán trái phép hóa đơn thuế GTGT đang diễn biến hết sức phức tạp với nhiều phương thức, thủ đoạn ngày càng tinh vi, xảo quyệt hơn trước. Hiện nay, các doanh nghiệp (DN) được phép tự in hóa đơn thuế GTGT cộng với việc đăng ký thành lập DN hết sức dễ dàng nên xuất hiện ngày càng nhiều “DN ma” và việc mua bán hóa đơn khống diễn ra bát nháo, cơ quan chức năng khó kiểm soát.
Để công tác phối hợp giữa ngành Thuế và Công an trong thời gian tới được tốt hơn, đại diện Phòng CSĐT tội phạm về TTQLKT&CV, Công an TP Hồ Chí Minh (PC46) cho biết: Ngành Thuế cần tăng cường hơn công tác hậu kiểm. Chú ý về hóa đơn, chứng từ “đầu ra, đầu vào” để phát hiện kịp thời các nghi vấn. Việc phối hợp của ngành Thuế để cung cấp thông tin, tài liệu về các đối tượng có nghi vấn theo yêu cầu của cơ quan điều tra hiện vẫn còn một số Chi cục chưa thực hiện tốt (hẹn quá lâu 1-3 tháng) như Chi cục Thuế quận 1, Chi cục Thuế quận 7. Hay vụ Công ty Orange Fashion do Cục Thuế chuyển qua từ năm 2011 nhưng đến nay vẫn chưa cung cấp đủ hồ sơ các doanh nghiệp liên quan có dấu hiệu vi phạm… gây khó khăn cho công tác xác minh, điều tra của cơ quan CSĐT.
Ngoài ra, việc mua bán hóa đơn GTGT đã gây thiệt hại rất lớn nhưng mức hình phạt quy định hiện nay không tương xứng. Trước đây khi còn áp dụng Thông tư liên tịch 21/2004/TTLT-BCA-TANDTC-VKSNDTC, thì hành vi mua bán hóa đơn được xử theo Điều 181 BLHS có khung hình phạt đến 20 năm. Tuy nhiên, ngày 20/11/2012, TAND Tối cao có Văn bản số 268/TANDTC – HS về việc “áp dụng điều luật đối với hành vi mua bán trái phép hóa đơn GTGT”, theo đó các hành vi mua bán hóa đơn GTGT không được áp dụng theo Thông tư liên tịch 21 mà xử lý theo Điều 164A có mức hình phạt cao nhất chỉ 5 năm. Đây là mức phạt quá nhẹ nên không có sức răn đe nên đề nghị tăng khung hình phạt cho phù hợp