Số tiền thuế nộp vào ngân sách qua thanh tra, kiểm tra là 7.786,5 tỷ đồng, bằng 66,5% tổng số kết luận tăng thu và bằng 127,2% so với cùng kỳ. Cơ quan thuế các cấp đã thực hiện thanh tra, kiểm tra 1.223 doanh nghiệp lỗ, doanh nghiệp có dấu hiệu chuyển giá; tổng số thuế truy thu, phạt và truy hoàn là 481,1 tỷ đồng; giảm lỗ là 1.697,5 tỷ đồng và giảm khấu trừ là 41,8 tỷ đồng.
Riêng lĩnh vực kinh doanh thương mại điện tử, qua hoạt động thanh tra đối với 2 doanh nghiệp, dự kiến số truy thu là hơn 103 tỷ đồng. Vì vậy, đây sẽ là một trong nội dung cơ quan thuế tăng cường thanh tra, kiểm tra trong năm 2014