Đoàn Thanh tra sẽ xây dựng kế hoạch thanh tra và thông báo lịch kiểm tra, làm việc tại các đơn vị. Trước đó, tại Hội nghị đối thoại Doanh nghiệp về chính sách vận tải năm 2014, trước phản ánh của đại diện doanh nghiệp Phương Trang tại Cần Thơ về việc giá xuất bến cao hơn bình thường (năm 2013 DN Phương Trang chi 1 tỷ đồng tiền phí xuất bến, nhưng trong 6 tháng đầu năm 2014 đã phải chi 1,8 tỷ đồng), Bộ trưởng Đinh La Thăng đã giao cho Thanh tra Bộ lập đoàn thanh tra đột xuất và trong tháng 7 phải có báo cáo Bộ trưởng về nội dung này