Đây cũng là con sông duy nhất chảy cắt ngang dãy trường sơn chia cao nguyên miền Nam thành 2 cao nguyên: Pleiku và Đắk Lắk. Từ thượng nguồn sông Ba chảy theo hướng Bắc Nam dài 300km đổ ra biển Đông tại cửa biển Đà Diễn thuộc Tuy Hòa, Phú Yên, tạo ra một vùng châu thổ rộng lớn.
Với diện tích trên 20.000ha, Tuy Hòa là đồng bằng rộng nhất Nam Trung bộ, được hệ thống thủy nông Đồng Cam cung cấp nước ngọt quanh năm, đây cũng là vựa lúa lớn nhất miền Trung. Sông Ba không chỉ gắn liền với văn hóa bao đời của người dân bản địa mà còn là nguồn sống của hàng triệu người dân xung quanh, nơi cung cấp nguồn nước sinh hoạt và nguồn nước phục vụ sản xuất cho nhiều địa phương ở phía Đông Nam của tỉnh Gia Lai.
Tuy nhiên, hiện nay con sông Ba đã dần cạn nước và bị ô nhiễm nặng. Những ngày này, đi qua thị xã An Khê, tỉnh Gia Lai có dòng sông Ba chảy qua, ai cũng phải bịt mũi vì không chịu nổi mùi hôi thối bốc lên vì ô nhiễm. Đó là kết quả từ nhiều năm nay dòng sông Ba trở thành nơi hứng chịu các nguồn nước thải công nghiệp tại các nhà máy tuyển quặng, nhà máy mía đường, nhà máy mỳ (sắn), nhà máy MDF...
Mặc dù các cơ quan chức năng địa phương đã nhiều lần kiểm tra, xử lý các nhà máy xả nước thải gây ô nhiễm môi trường trên sông Ba, nhưng cuối cùng đâu vẫn vào đó vì không thể đóng cửa nhà máy được. Đặc biệt là từ khi công trình thủy điện An Khê - Ka Nak chặn dòng, tích nước trong thời gian dài đã làm mực nước trên sông Ba xuống thấp, dòng chảy ứ đọng nước không đủ để đẩy trôi các chất cặn bã, làm cho sự ô nhiễm ở đây ngày càng trầm trọng hơn.
Trước thực trạng này, không thể di dời cả hàng chục ngàn dân thị xã An Khê đi nơi khác được nên chính quyền địa phương, các ngành đã huy động lực lượng đoàn viên thanh niên thu gom rác thải để làm làm sạch môi trường, đề xuất với tỉnh Gia Lai cho xây một số hồ điều hòa trên sông Ba, nhằm khắc phục sự cố ô nhiễm tạm thời cho cuộc sống người dân.
Hiện tại khoảng 2.500 hộ dân ở đây dùng nước máy bị ảnh hưởng từ dòng sông Ba, không biết tương lai cuộc sống sinh hoạt của người dân thị xã An Khê, Gia Lai sẽ ra sao