Báo cáo của BHXH địa phương cho thấy, một trong những nguyên nhân chính là cơ quan tài chính chưa bố trí hoặc chưa cấp, cấp chưa đủ, chậm cấp kinh phí phần 1% trách nhiệm đóng BHTN của người sử dụng lao động để đơn vị đóng theo quy định, phần hỗ trợ quỹ BHTN của ngân sách địa phương cũng còn vướng mắc.
Việc xử lý nợ BHTN đối với các đơn vị hành chính, sự nghiệp gặp nhiều khó khăn; Luật BHXH quy định về việc tính lãi chậm đóng. Trong khi các đơn vị này không có nguồn kinh phí để đóng tiền lãi theo quy định (ngân sách không bố trí nguồn để trả lãi do chậm đóng)