Kết quả quan trắc của Trung tâm Quan trắc và Dự báo tài nguyên nước cho thấy, ở đồng bằng Bắc Bộ, mực nước ngầm hạ sâu, đặc biệt ở khu vực Mai Dịch (Cầu Giấy, Hà Nội); ở Nam Bộ, mực nước ngầm cũng xuống rất thấp ở khu vực quận 12, quận Bình Tân (TP Hồ Chí Minh). Đáng báo động, nguồn nước ngầm đang bị ô nhiễm nghiêm trọng, gây ảnh hưởng tới chất lượng nước sinh hoạt.
Tại đồng bằng Bắc Bộ, về mùa khô, cả 7/7 mẫu đều có hàm lượng amoni cao hơn tiêu chuẩn cho phép nhiều lần. Riêng ở Tân Lập (Đan Phượng, Hà Nội), hàm lượng amoni lên đến 23,30mg/l (gấp 233 lần tiêu chuẩn cho phép). Ngoài ra, còn có 17/32 mẫu có hàm lượng mangan (Mn) vượt quá hàm lượng tiêu chuẩn, 4/32 mẫu có hàm lượng asen (As) vượt tiêu chuẩn…
Hiện nay, chỉ có Tây Nguyên là vùng có tầng nước ngầm khá an toàn