Hiện nay, nước ta có khoảng 12 triệu ha diện tích gieo trồng mỗi năm, theo đó, tổng lượng phân bón sử dụng khoảng 10 triệu tấn. Thời gian qua, việc sản xuất và sử dụng phân bón có nhiều tiến bộ, lượng phân nhập khẩu giảm, nhiều sản phẩm phân bón được sản xuất chuyên dụng cho từng loại cây trồng; sản phẩm phân bón ngoài chất dinh dưỡng đa lượng (N-P-K) còn được bổ sung các chất dinh dưỡng trung lượng hoặc vi lượng…Tuy nhiên, trong sản xuất, kinh doanh và sử dụng phân bón ở nước ta vẫn còn một số hạn chế. Xu hướng lạm dụng phân bón hóa học khá phổ biến, nhất là phân đạm trong sản xuất lúa, cà phê; việc sử dụng phân bón theo “4 đúng” (đúng chủng loại, đúng liều lượng, đúng thời thời gian, đúng phương pháp) chưa được tuân thủ theo khuyến cáo. Vì vậy, hiệu quả sử dụng phân bón thấp, gây ra thiệt hại kinh tế, ảnh hưởng xấu đến môi trường. Ngoài ra, tình trạng sản xuất, kinh doanh phân bón chất lượng kém, hàm lượng chất dinh dưỡng không như công bố phổ biến. Nghiêm trọng hơn là sản xuất, kinh doanh phân bón giả, đặc biệt đối với phân hữu cơ sinh học, phân bón lá, phân vi sinh…
Theo Viện Chính sách và chiến lược phát triển nông nghiệp nông thôn, thời gian tới, nước ta cần đẩy mạnh đổi mới quản lý nông nghiệp theo Nghị định 57/2007/NĐ-CP của Chính phủ về việc đơn giản hóa thủ tục hành chính, trong đó rất nhiều thủ tục hành chính liên quan đến phân bón. Cần sớm ban hành đầy đủ các tiêu chuẩn và qui chuẩn kỹ thuật quốc gia để doanh nghiệp áp dụng và các cơ quan quản lý nhà nước có căn cứ để kiểm tra, giám sát việc tuân thủ yêu cầu kỹ thuật của doanh nghiệp sản xuất, kinh doanh phân bón. Ngoài ra, theo các chuyên gia, nước ta cần nhanh chóng thành lập hệ thống quản lý phân bón xuyên suốt từ Trung ương đến địa phương. Hoàn thiện qui hoạch hệ thống sản xuất và cung ứng phân bón một cách hợp lý. Khép kín hệ thống từ sản xuất đến đại lý, cửa hàng để quản lý chất lượng, chống hàng giả…
