Các DN cảng 100% vốn Nhà nước như Hải Phòng, Sài Gòn, Quảng Ninh, Đà Nẵng, Nha Trang, Cam Ranh, Nhơn, Cần Thơ, Cái Cui (được đầu tư chủ yếu bằng vốn ngân sách) dù có lãi nhưng tỷ suất lợi nhuận thấp, các cảng liên doanh với nước ngoài như CICT, SSIT, SP-PSA và CMIT hiện đều lỗ lớn, Vinalines xác định mục tiêu chủ yếu của năm 2013 là sắp xếp, tái cơ cấu doanh nghiệp, duy trì ổn định sản xuất kinh doanh, đảm bảo đời sống của người lao động