Các lĩnh vực thanh tra sẽ tập trung vào các ngành như: Tài chính ngân hàng, dược phẩm, bất động sản, điện lực, dầu khí, bưu chính viễn thông, khoáng sản. Cùng với đó, sẽ tập trung vào các doanh nghiệp FDI; doanh nghiệp có giao dịch liên kết; doanh nghiệp có dấu hiệu chuyển giá; doanh nghiệp kinh doanh lỗ; doanh nghiệp có nợ thuế lớn; doanh nghiệp nhiều năm chưa được thanh tra, kiểm tra, doanh nghiệp hưởng ưu đãi, miễn giảm thuế.
Đối với các doanh nghiệp có vốn đầu tư lớn trên địa bàn, Cục Thuế báo cáo Uỷ ban nhân dân tỉnh, thành phố về kế hoạch thanh tra, nhiệm vụ kiểm tra thuế của cục và đề nghị UBND tỉnh chỉ đạo các đơn vị có liên quan phối hợp thực hiện