Tuy nhiên, kể từ khi nút giao Thanh Xuân - Nguyễn Trãi được thông xe, thì thực tế đã không như mong muốn. Bởi ngay sau khi thông xe đã xuất hiện tình trạng ùn tắc giao thông cục bộ ngay tại chính nút giao thông này. Nguyên nhân dẫn đến tình trạng ùn tắc là do các phương tiện chiều từ Hà Đông ra rất đông, gặp ngay dòng phương tiện từ đường Khuất Duy Tiến đi vào nút để tiếp tục đi Linh Đàm, hoặc rẽ trái ra đường Nguyễn Trãi gây ùn tắc.
Trong khi đó, tại nút lúc này chỉ có 3 CSGT làm nhiệm vụ hướng dẫn phân luồng giao thông nên làm không xuể. Dù lực lượng CSGT đã đưa ôtô chặn ngang đường không cho các phương tiện đi từ đường Khuất Duy Tiến cắt ngang qua nút mà phải tiếp tục di chuyển chiều Ngã Tư Sở - Hà Đông quay đầu xe trước Bách hóa Thanh Xuân.
Tuy nhiên, do dải phân cách giữa trên đường Nguyễn Trãi chưa hoàn thành nên rất nhiều ôtô đã leo qua dải phân cách cắt ngang dòng phương tiện chiều Hà Đông - Ngã Tư Sở gây nên cảnh hỗn loạn và ùn tắc là điều không tránh khỏi.
Về nguyên nhân tắc, nhiều người cho rằng do vòng tròn để bắt buộc đi vòng mỗi khi qua nút làm quá rộng chiếm hết diện tích của các phương tiện lưu thông là nguyên nhân gây ùn tắc