Theo Hệ thống Cảnh báo nhanh (RASFF) của EU, trong tháng 3/2012, EU chỉ cảnh báo 1 lô cá tra philê đông lạnh của Việt Nam xuất khẩu sang Đức bị nhiễm khuẩn E.coli, giảm so với 3 lô trong tháng 1 và 5 lô trong tháng 2/2012.
Về cảnh báo của thị trường Mỹ đối với thủy sản xuất khẩu từ Việt Nam, theo Cục Quản lý Thực phẩm và Dược phẩm Mỹ (FDA), trong tháng 3/2012, Việt Nam nhận 12 cảnh báo vì có chứa tạp chất, chất hình thành trong quá trình phân hủy và không đảm bảo điều kiện vệ sinh an toàn thực phẩm trong bao gói sản phẩm, chủ yếu là các lô hàng cá dũa (6 lô) và cá ngừ (3 lô).
Tại thị trường Nhật Bản, theo số liệu của Bộ Y tế, Lao động và Phúc lợi Nhật Bản, số lô thủy sản nhập khẩu từ Việt Nam bị cảnh báo giảm còn 6 lô trong tháng 3/2012. Đáng chú ý, trong tháng 3 chỉ duy nhất có một lô tôm bị nhiễm Enrofloxacin so với 13 lô trong tháng 1 và 6 lô trong tháng 2. Kể từ tháng 6/2011, số lô thủy sản xuất khẩu của Việt Nam bị Nhật cảnh báo luôn dao động từ 10 - 19 lô và vẫn giữ mức cao trong 2 tháng đầu năm 2012