Từ thông tin tố cáo trên, Tổ xác minh của Bộ Giao thông vận tải (GTVT) đã làm việc trực tiếp với 30 người có tên trong đơn tố cáo. Kết luận số 13802/KL-BGTVT về nội dung tố cáo “gia đình trị” tại VMS-South do Bộ trưởng Bộ GTVT Đinh La Thăng ký cho thấy, kết quả xác định có 15 người/30 người có quan hệ gia đình với Tổng giám đốc Tổng công ty, như vậy nội dung tố cáo 50% là có cơ sở và 50% là không có cơ sở.
Tính đến ngày 31-8-2015, tổng số cán bộ, lãnh đạo, quản lý của VMS-South là 155 người, trong đó cán bộ lãnh đạo, quản lý có quan hệ gia đình với tổng giám đốc là 11 người, chiếm 7%.
Tổ xác minh của Bộ GTVT khẳng định, trong số 15 người có quan hệ gia đình, họ hàng với Tổng Giám đốc VMS-South thì có 8 người thuộc quyền bổ nhiệm của Tổng Giám đốc. Còn lại, 1 người thuộc thẩm quyền bổ nhiệm của Hội đồng thành viên được bổ nhiệm ngày 28-7-2015 và 1 người thuộc thẩm quyền bổ nhiệm của Đảng ủy Tổng Công ty được bổ nhiệm ngày 23-6-2014.
