Tổng mức đầu tư cho dự án này gần 1.600 tỷ đồng, trong đó tuyến cáp ngầm xuyên biển có kinh phí khoảng 1.500 tỷ đồng. Do nguồn vốn đầu tư quá lớn và Chính phủ thiếu kinh phí hỗ trợ, nên Phó Thủ tướng Hoàng Trung Hải đã giao cho EVN chỉ đạo Tổng Công ty ĐLMN xây dựng Đề án thành lập Công ty cổ phần Điện lực Phú Quốc để huy động vốn.
Ngoài vốn điều lệ dự kiến vào khoảng 680 tỉ đồng, Công ty cổ phần Điện lực Phú Quốc đề nghị Chính phủ cho vay 70% tổng mức vốn đầu tư cho dự án theo hình thức vay ưu đãi thời hạn 12 năm (ân hạn 2 năm)