Trước đó, ngày 1/11 là ngày đầu tiên áp dụng chính thức CKS trong thực hiện TTHQĐT theo Quyết định 2341/QĐ-BTC ngày 18/9/2013 của Bộ Tài chính.
Những ngày đầu triển khai quy định này, việc sử dụng CKS để thực hiện TTHQĐT diễn ra khá thông suốt, không gặp vướng mắc gì trong xử lí của hệ thống hay đường truyền. Tuy nhiên, vẫn có phát sinh tình huống DN sử dụng CKS không đúng với CKS đã đăng ký với cơ quan Hải quan dẫn đến tờ khai không được chấp nhận (vì không sử dụng đúng CKS đã đăng ký với cơ quan Hải quan)