Cảng Cần Thơ là cảng hàng hóa tổng hợp quốc gia đầu mối khu vực (loại 1) gồm các khu bến: Cái Cui, Hoàng Diệu, Trà Nóc nằm trong nhóm cảng biển số 6 thuộc Quy hoạch phát triển hệ thống cảng biển Việt Nam đến năm 2020, định hướng đến năm 2030.
Năm 2010 có 19,3 triệu tấn hàng từ các cảng trên sông Hậu được xuất đi nhưng 80% trong số này phải quá cảnh sang các cảng ở Đông Nam Bộ (nhóm cảng biển số 5) làm tăng chi phí vận chuyển, gây áp lực lên hệ thống giao thông đường bộ…
Theo dự kiến, đến tháng 5/2011 bắt đầu nạo vét luồng Định An