Ngoài ra, đã có 23 tỉnh phê duyệt tiền cấp quyền khai thác khoáng sản với tổng số tiền là hơn 200 tỷ đồng. Tuy nhiên, hiện nay, phần lớn doanh nghiệp cho rằng không nên thu tiền cấp quyền khai thác khoáng sản đối với phần trữ lượng đã khai thác từ ngày 1/7/2011 (ngày Luật Khoáng sản 2010 có hiệu lực) đến ngày 31/12/2013 (ngày Nghị định 203/2013 có hiệu lực).
Về vấn đề này, Thứ trưởng Bộ Tài nguyên - Môi trường Trần Hồng Hà cho rằng, kiến nghị của các doanh nghiệp khoáng sản là đúng đắn. Bởi thời điểm từ 1/7/2011 đến 31/12/2013, các doanh nghiệp khai thác khoáng sản đã hoàn thành quyết toán hàng năm; công bố lỗ, lãi và nộp các khoản thuế, phân chia lợi nhuận. Hơn nữa, trong bối cảnh kinh tế thế giới và Việt Nam đang gặp khó khăn, giá khoáng sản chỉ còn 30-50% so với thời điểm cao nhất, nhiều doanh nghiệp khoáng sản báo lỗ. Vì vậy, việc hồi tố thu tiền cấp phép khai thác khoáng sản trong khoảng thời gian trên là khó khả thi.
Theo báo cáo, đến nay, tổng số tiền cấp quyền khai thác khoáng sản chưa thu trong khoảng thời gian trên là hơn 1.700 tỷ đồng. Bộ Tài nguyên - Môi trường đã báo cáo, kiến nghị Thủ tướng Chính phủ đề nghị Ủy ban Thường vụ Quốc hội xem xét, miễn thu tiền cấp quyền khai thác khoáng sản đối với phần trữ lượng đã khai thác từ ngày 1/7/2011 đến ngày 31/12/2013
