Theo cơ quan điều tra, năm 1993, Lê Thanh Hải lập DNTN Thanh Hải với vốn điều lệ (theo giấy ĐKKD thay đổi lần 9 ngày 9/1/2010) là 10 tỷ đồng, trụ sở đặt tại khu dân cư chợ Cái Sách, xã Thường Thới Hậu A, huyện Hồng Ngự (Đồng Tháp). Trước đó, vào tháng 7/2007, DN này cho ra đời Chi nhánh Thanh Hải I đặt tại huyện Châu Phú (An Giang). Đầu tháng 8/2009, sau khi mua lại nhà máy của Công ty TNHH SXTM Toàn Phát tại xã Tân Thành, huyện Lai Vung (Đồng Tháp), Hải biến nơi đây thành Chi nhánh Thanh Hải II.
Kết quả điều tra cho thấy, sau khi chi nhánh Thanh Hải II đi vào hoạt động, dù đã nợ và không còn khả năng thanh toán số tiền lớn đối với nhiều hộ dân nuôi cá tra, nhưng tháng 8/2010, ông Hải vẫn tiếp tục lập Công ty TNHH XNK Thủy sản Thanh Hải với vốn điều lệ 10 tỷ đồng, đặt cùng địa chỉ với DNTN Thanh Hải. Hải trực tiếp điều hành công ty này.
Trong thời gian mua cá tra nguyên liệu để chế biến cá phi lê xuất bán, từ tháng 8/2009 đến tháng 9/2011, với hai công ty của mình, ông Hải đã nợ của 24 nông dân nuôi cá với số tiền gần 34 tỷ đồng nhưng không còn khả năng thanh toán, trong đó DNTN Thanh Hải nợ trên 31,8 tỷ đồng (của 19 nông dân); còn lại là Công ty TNHH XNK Thanh Hải.
Khi bị các “chủ nợ” là nông dân liên tục bao vây nhà máy đòi nợ, tháng 1/2012, ông Hải báo cáo với chính quyền và cơ quan chức năng DNTN Thanh Hải đã ngưng hoạt động nhưng không đưa ra phương án xử lý các khoản nợ. Kết quả điều tra cho thấy nguồn vốn của công ty mới thành lập hoàn toàn chỉ thể hiện trên giấy nên ông Hải đã điều hành làm các hợp đồng chuyển hóa cá phi lê và tài sản của DNTN Thanh Hải sang Công ty TNHH XNK Thủy sản Thanh Hải; đồng thời từ là thành viên thành lập công ty, ông Hải cũng chuyển vốn qua cho con mình. Không có tư cách pháp nhân gì nhưng ông Hải vẫn lặng lẽ điều hành Công ty TNHH XNK Thủy sản Thanh Hải, tiếp tục lừa đảo thêm 5 nạn nhân, với số tiền trên 1,5 tỷ đồng.
Đối với bị can Đặng Thị Loan, theo cơ quan điều tra, sau khi ly dị với chồng, Loan đã sống chung như vợ chồng với Lê Thanh Hải từ năm 2002. Khi Hải lập Công ty TNHH XNK Thủy sản Thanh Hải, Loan được Hải phong cho cái chức “giám đốc”. Chưa đầy 3 tháng sau đó, tức ngày 16/11/2010, Loan được Hải cho làm Chủ tịch HĐTV, đại diện theo pháp luật. Vốn góp của Loan thể hiện trên giấy lúc đó là 30% nhưng thực chất bà Loan chẳng hề bỏ tiền vào.
Bà Loan khai rằng khi làm người đại diện theo pháp luật cho Công ty TNHH XNK Thủy sản Thanh Hải, mình chỉ biết mỗi việc ký tên (?). Chuyện quan hệ giao dịch với ngân hàng, hay quan hệ mua cá tra nguyên liệu, hồ sơ dây chuyền sản xuất cá tra phi lê,… đều do ông Hải tự làm, bà không hề biết gì hết do không biết chữ. Ông Hải đưa ký thì ký. Cho tới khi bị khởi tố, bắt tạm giam bà mới biết công ty do mình làm Chủ tịch HĐTV nợ dân nuôi cá tra, nợ ngân hàng,… số tiền khủng (?).
Loan khai thế nhưng những người có liên quan như Nguyễn Công Thành, Giám đốc Công ty TNHH XNK Thủy sản Thanh Hải, Lê Văn Hường, Lê Thị Quời, Lê Thị Tuyến Hồng (đều là con ông Hải),… lại khai bà Loan tuy không biết rành chữ nhưng bà và ông Hải đã “đạo diễn” họ làm nhiều việc.
Cơ quan điều tra khẳng định, dù không biết rành chữ, chỉ biết ký tên, nhưng Loan đã cùng Hải ký toàn bộ các hợp đồng thu mua, tẩu tán tài sản, giúp Hải thực hiện hành vi chiếm đoạt của nhiều nông dân nuôi cá số tiền lớn. Hành vi của Loan đã thể hiện rõ vai trò đồng phạm với bị can Hải.
Kết luận điều tra còn cho biết, ngoài khoản nợ như đã kể trên, hiện DNTN Thanh Hải và Công ty TNHH XNK Thủy sản Thanh Hải còn nợ các chủ nợ khác là đối tác cung cấp bao bì, thùng carton, thức ăn nuôi cá và tiền vay từ 2 Ngân hàng Vietinbank và Eximbank (chi nhánh Cần Thơ) gần 60,5 tỷ đồng
