Ngay sau đó, Sở GD&ĐT Hà Nội đã lập đoàn thanh tra xác minh clip trên và ngày 13/6, Sở đã có kết luận về vụ việc này như sau: Xác minh 20 đoạn hình ảnh được cung cấp, đối chiếu với thực tế tại hội đồng coi thi Trường THPT Quang Trung, Hà Đông, trong đó có 1 đoạn hình ảnh ở phòng thi số 50, 19 đoạn hình ảnh ở phòng thi số 35 trong thời gian thi môn toán và ngoại ngữ.
Trong đó đã xác minh hiện tượng giám thị để thí sinh mất trật tự và trao đổi bài chỉ xảy ra ở phòng thi số 35 ở thời gian cuối của 2 buổi thi môn toán và ngoại ngữ. Trực tiếp làm việc với tất cả các giám thị của Hội đồng coi thi, yêu cầu các giám thị làm bản tường trình về toàn bộ quá trình làm việc tại hội đồng coi thi, việc chấp hành quy chế thi của bản thân và các thành viên của hội đồng coi thi. Hội đồng coi thi đã tổ chức tốt việc học tập quy chế, làm việc nghiêm túc, cơ bản hoàn thành nhiệm vụ. Đã làm việc trực tiếp với lãnh đạo hội đồng (chủ tịch, các phó chủ tịch, các thư ký), tổ thanh tra tại hội đồng và các giám thị 1, 2, 3 của phòng thi số 35 trong hai buổi thi môn toán và ngoại ngữ. Các giám thị có trong đoạn hình ảnh được cung cấp làm bản tường trình, tự nhận khuyết điểm và mức độ kỷ luật.
Tại phòng thi số 35 ở những phút cuối của hai môn toán và ngoại ngữ, thí sinh mất trật tự, trao đổi bài, giám thị thiếu trách nhiệm khi coi thi, không kiên quyết nhắc nhở thí sinh trong phòng thi, giám thị không hoàn thành nhiệm vụ. Căn cứ vào kết luận trên và xét tính chất sự việc, sai phạm không có tổ chức, mang tính tự phát và chỉ xảy ra ở 1 hội đồng thi, thanh tra thi tại hội đồng chịu trách nhiệm liên đới.
Căn cứ vào quy chế thi tốt nghiệp THPT hiện hành, Sở GD&ĐT Hà Nội đã có hình thức kỷ luật các thành viên: Đối với lãnh đạo hội đồng coi thi (HĐCT): Bà Cao Thị Kim Thu (Phó Hiệu trưởng Trường THPT Phú Xuyên A) - Chủ tịch hội đồng chịu hình thức kỷ luật khiển trách. Lý do vì thiếu bao quát, chưa kiểm tra đầy đủ toàn hội đồng trong việc thực hiện quy chế thi, để xảy ra tình trạng thí sinh mất trật tự, trao đổi bài. Các phó chủ tịch và thư ký HĐCT chịu hình thức kỷ luật phê bình, rút kinh nghiệm sâu sắc do chưa chuẩn bị chu đáo các điều kiện bảo đảm an toàn tổ chức kỳ thi.
Đối với các giám thị (GT): Cảnh cáo đối với 4 GT trong phòng thi số 35 của môn toán và ngoại ngữ, gồm các ông/bà: Hà Viết Sử, Kiều Thị Kim Thoa (THPT Chúc Động), Chu Thị Hường, Vũ Thành Đức (THPT chuyên Nguyễn Huệ). Khiển trách đối với 2 GT ngoài phòng thi số 35 của môn toán và ngoại ngữ, gồm các bà: Nguyễn Thị Nhung (THPT chuyên Nguyễn Huệ), Nguyễn Thị Hiền (Trung tâm giáo dục thường xuyên Thạch Thất). Ngoài ra Sở GD&ĐT còn đề nghị hình thức kỷ luật khiển trách đối với 2 GT có trong đoạn clip do bỏ vị trí được phân công, gồm ông Đinh Hữu Lâm và bà Tạ Thị Thu Hương (THPT chuyên Nguyễn Huệ).
Đối với thanh tra: Khiển trách đối với cán bộ thanh tra Nguyễn Ngọc Quỳnh (THPT Chương Mỹ A) - phụ trách khu vực phòng thi số 35, do thiếu kiên quyết khi làm nhiệm vụ. Phê bình, rút kinh nghiệm sâu sắc đối với Tổ trưởng thanh tra là bà Vương Thị Bích Hòa (THPT Ứng Hòa), ông Nguyễn Hồng Long (THPT Vân Tảo) và bà Đinh Thị Thu (THPT Mỹ Đức A).
Sở GD&ĐT yêu cầu thủ trưởng các đơn vị có cán bộ, giáo viên vi phạm tổ chức kiểm điểm và kỷ luật cán bộ, giáo viên liên quan theo đúng thủ tục hiện hành. Thời gian thực hiện trước ngày 25/6/2013