Khoảng 15h ngày 1/6, anh Trường thuê hai thợ hàn là Lê Ngọc Trường An (16 tuổi, ngụ ở phường Tân Lộc, quận Thốt Nốt, TP Cần Thơ) và Trần Phú Thọ (chưa rõ quê quán) đến thi công khoét van bồn dầu (thể tích 25.000 lít) để chứa mỡ cá tra do cơ sở chế biến. Hai anh An và Thọ dùng bình gió đá khoét bồn dầu được khoảng 10 phút thì dầu cặn trong bồn bắt lửa bốc cháy từ bên trong gây phát nổ.
Vụ nổ khiến thợ hàn Lê Ngọc Trường An và một công nhân của cơ sở chế biến mỡ cá là anh Phạm Hoàng Thanh tử vong tại chỗ. Còn thợ hàn Trần Phú Thọ và chủ cơ sở chế biến mỡ cá là anh Nguyễn Văn Trường bị trọng thương, được đưa đi cấp cứu tại Bệnh viện ĐKTW Cần Thơ