Theo thống kê của Sở Y tế Cần Thơ, trên địa bàn có 25 bệnh viện; 1 trung tâm y tế huyện; 1 trường cao đẳng y tế; 1 công ty dược; 13 đơn vị y tế thuộc khối dự phòng, 85 trạm y tế và nhiều phòng khám tư nhân. Theo ông Cao Minh Chu - Phó Giám đốc Sở Y tế Cần Thơ, tại các bệnh viện trên địa bàn thành phố, trung bình khối lượng CTRYT phát sinh khoảng trên 6,3 tấn/ngày. Trong đó, rác thông thường là 5,3 tấn, rác nguy hại là gần 1 tấn, nhưng chỉ có 8/25 bệnh viện có lò đốt rác thải y tế (7 bệnh viện trang bị lò đốt hai buồng và một lò đốt thủ công).
Khởi công xây dựng Nhà máy Xử lý CTRYT nguy hại đóng trên địa bàn phường Phước Thới,quận Ô Môn (Cần Thơ).
Theo khảo sát của ngành Y tế, các bệnh viện đã được trang bị lò đốt để tiến hành xử lý CTRYT như: BVĐKTW Cần Thơ, BV Quân y 121 (QK9), BV Lao và Bệnh phổi, BVĐK Thốt Nốt, BVĐK Ô Môn, BVĐK Phong Điền, BVĐK Vĩnh Thạnh, BVĐK Thới Lai... Còn tại các cơ sở y tế dự phòng có 70% cơ sở y tế dự phòng xử lý CTRYT bằng lò đốt 2 buồng, 30% còn lại xử lý bằng lò đốt 1 buồng, đốt thủ công hoặc bằng phương pháp khác. Riêng tại các trạm y tế thực hiện thu gom, xử lý CTRYT bằng lò đốt thủ công hoặc chôn lấp trong khuôn viên trạm y tế. Tuy nhiên, hầu hết các lò đốt hiện đang trong tình trạng quá tải, xuống cấp. Cá biệt, ở những đơn vị sử dụng lò đốt thủ công đang gây ảnh hưởng nghiêm trọng tới môi trường xung quanh.
Tại các cơ sở sử dụng lò đốt đều chưa có biện pháp xử lý tro lò đốt một cách an toàn và đảm bảo vệ sinh môi trường. Các đơn vị sau khi đốt còn lúng túng chưa có giải pháp hợp lý và lượng tro tồn lưu ngày càng nhiều. Công tác phân loại, thu gom, vận chuyển và lưu giữ tạm thời CTRYT trong các bệnh viện còn gặp nhiều hạn chế dẫn đến quá trình phân loại, thu gom, vận chuyển và lưu giữ chưa đúng theo quv định của Bộ Y tế.
Ông Cao Minh Chu cho biết thêm, Cần Thơ chưa có nhà máy xử lý rác thải, đặc biệt là CTRYT nguy hại tập trung tại các bệnh viện. Do đó, công tác phân loại, thu gom, vận chuyển và lưu giữ tạm thời CTRYT của các cơ sở y tế trên địa bàn gặp rất nhiều khó khăn. Dự kiến, đến năm 2020 khối lượng CTRYT phát sinh trên địa bàn ước tính trên 10 tấn/ngày, trong đó CTRYT nguy hại phát sinh khoảng 1,6 tấn/ngày, chất thải thông thường khoảng 8,7 tấn/ngày. Vì vậy, giai đoạn từ nay đến năm 2015, Cần Thơ sẽ quy hoạch xử lý CTRYT nguy hại theo mô hình tập trung. Phía Sở Y tế đã đề nghị BQL dự án hỗ trợ xử lý chất thải bệnh viện (Bộ Y tế) đầu tư hệ thống xử lý CTRYT nguy hại theo mô hình tập trung bằng vốn vay của Ngân hàng Thế giới (WB), vốn đối ứng địa phương và các nguồn vốn hợp pháp khác.
Trung tuần tháng 3/2014, ngành chức năng của Cần Thơ đã làm việc với BQL dự án Bộ Y tế và chuyên gia của WB về một số nội dung của báo cáo tóm tắt dự án “Hỗ trợ xử lý CTRYT trên địa bàn TP Cần Thơ”. Tại buổi làm việc, phía Cần Thơ trình bày dự án đầu tư hệ thống xử lý CTRYT nguy hại tập trung với tổng mức đầu tư khoảng 4 triệu USD (khoảng 91 tỷ đồng), trong đó vốn vay ODA là 84 tỷ đồng, vốn đối ứng của thành phố là 6,8 tỷ đồng. Dự án sẽ áp dụng công nghệ tiên tiến thân thiện với môi trường và các bên đã thống nhất với đề án này. Tuy nhiên, phía WB đề nghị làm rõ thêm khối lượng rác thải y tế của Cần Thơ vì số liệu cập nhật chưa chính xác và đánh giá hiệu quả kinh tế mang lại từ dự án, trong đó lưu ý vấn đề giá thành xử lý, đơn vị thực hiện vận hành dự án…
Riêng đại diện BQL dự án Bộ Y tế đề nghị bổ sung thêm việc xử lý nước rỉ từ rác thải y tế như thế nào, vị trí tập kết phân loại, đánh giá tác động môi trường đối với việc ảnh hưởng nguồn nước ngầm. Phía Cần Thơ cam kết sẽ chỉnh sửa, thực hiện để hoàn thiện các vấn đề trên trong thời gian sớm nhất