Nếu phát hiện ra vi phạm, trước hết ngành Đường sắt sẽ xử lý về mặt hành chính; nếu có dấu hiệu hình sự sẽ xử lý theo quy định của pháp luật.
Cũng theo ông Nguyễn Văn Công, theo báo cáo ban đầu của Tổng Công ty Đường sắt Việt Nam, lô hàng trên đã được liên ngành Thuế - Hải quan - Quản lý thị trường kiểm tra và cho phép nên ngành Đường sắt thực hiện bán cước đầy đủ, không có gian lận về cước