Theo nội dung vụ việc: Công ty Chỉ Ming Shyang là công ty chuyên sản xuất chỉ may, chỉ thêu các loại. Đầu tháng 9/2009, sau khi kiểm tra thuế giá trị gia tăng, thuế thu nhập doanh nghiệp, thuế thu nhập cá nhân tại công ty này, Cục Thuế TP đã ban hành quyết định xử phạt hành chính số tiền gần 542 triệu đồng. Đồng thời, còn truy thu thuế giá trị gia tăng hơn 256 triệu và thuế thu nhập doanh nghiệp 258 triệu đồng. Không đồng ý công ty khiếu nại, Cục Thuế TP đã ra quyết định công nhận một phần nội dung khiếu nại. Cụ thể, Cục Thuế TP đã sửa đổi lại số tiền phạt giảm còn khoảng 475 triệu đồng và giảm số tiền truy thu thuế giá trị gia tăng còn 190 triệu đồng.
Không bằng lòng với quyết định xử phạt trên, Công ty Chỉ Ming Shyang nộp đơn ra TAND TP HCM yêu cầu hủy cả hai quyết định xử phạt cùng quyết định giải quyết khiếu nại của Cục Thuế vì cho rằng sản phẩm của công ty dùng để xuất khẩu và tiêu thụ nội địa, những sản phẩm này được sử dụng chung một loại nguyên liệu sợi và sản xuất trên cùng một dây chuyền thiết bị; lý do số nguyên liệu ít hơn thành phẩm nhập kho và tiêu thụ trong năm 2008 là do có thành phẩm xuất khẩu năm 2007 nhưng xuất hóa đơn 2008… Thực tế công ty không thiếu sản phẩm so với định mức đã đăng ký với hải quan khiến Cục Thuế phải xử phạt và truy thu như trên.
Còn theo lý giải của Cục Thuế, Công ty Chỉ Ming Shyang vi phạm chế độ sổ sách kế toán như không mở sổ kho hoặc thẻ kho; số lượng nguyên vật liệu sản xuất và thành phẩm thu hồi có sự chênh lệch so với định mức đăng ký với hải quan, hạch toán nguyên vật liệu và thành phẩm sản xuất tiêu thụ không chính xác…
Xử sơ thẩm tháng 8, TAND TP nhận định thời hạn và trình tự ban hành quyết định xử phạt của Cục Thuế là đúng luật nên đã bác yêu cầu khởi kiện của Công ty Chỉ Ming Shyang yêu cầu hủy quyết định xử phạt hành chính của Cục thuế TP. Không đồng tình, Công ty Chỉ Ming Shyang đã kháng cáo yêu cầu xét xử lại
