Vụ việc khởi nguồn từ 6/2009 khi cơ quan ANĐT TP Hải Phòng phát hiện 2 quyển hoá đơn GTGT giả được lưu hành trên toàn quốc. Lần theo nguồn gốc số hóa đơn trên, cơ quan điều tra đã ra lệnh bắt khẩn cấp Nguyễn Đình Thi, Giám đốc Công ty TNHH Phương Nam (46 đại lộ Tôn Đức Thắng, An Dương) về hành vi "mua bán giấy tờ có giá giả" (hoá đơn GTGT). Linh cảm thấy sắp bị pháp luật sờ gáy, Thi đã nhanh chân đưa vợ con bỏ trốn.
Qua khám xét nơi ở của Thi tại số 272 đại lộ Tôn Đức Thắng, xã An Đồng, huyện An Dương, các điều tra viên đã thu được nhiều hoá đơn, chứng từ và 4 bộ dấu của các Công ty TNHH do Đỗ Thị Liễu, 35 tuổi, ĐKTT tại An Hưng, huyện An Dương, Hải Phòng, kẻ lập ra để mua bán trái phép hoá đơn GTGT. Lần theo manh mối của đối tượng, 22/8/2009, tại xã Tân Phước, thị xã La Gi, tỉnh Bình Thuận, các trinh sát An ninh Hải Phòng phối hợp với Công an tỉnh Bình Thuận đã bắt gọn Nguyễn Đình Thi.
Tiếp đó, ngày 28/10/2009, cơ quan ANĐT Công an Hải Phòng đã ra lệnh bắt khẩn cấp Đỗ Thị Liễu khi thị đang lẩn trốn tại TP HCM