Đây là bước triển khai cụ thể sau khi Quyết định 01/2025/QĐ-TTg có hiệu lực từ ngày 18/2/2025, quy định hàng hóa nhập khẩu giá trị thấp được miễn thuế nhập khẩu nhưng phải nộp thuế VAT. Trước đó, theo Quyết định 78/2010/QĐ-TTg, nhóm hàng này được miễn cả hai loại thuế.
Tuy nhiên, do hệ thống hải quan chưa cập nhật kịp thời, việc thu VAT thời gian qua phải thực hiện thủ công, gây khó khăn cho cả cơ quan quản lý và doanh nghiệp, đồng thời tiềm ẩn rủi ro sai sót và thất thu ngân sách.
Để khắc phục, Thông tư 29 đã thiết lập cơ sở pháp lý và kỹ thuật cho việc thu VAT tự động qua hệ thống hải quan điện tử, tạo thuận lợi cho doanh nghiệp, minh bạch trong quản lý và đảm bảo thu đúng, thu đủ ngân sách Nhà nước. Giai đoạn thí điểm sẽ diễn ra từ ngày 9 đến 31/7/2025 với một số doanh nghiệp chuyển phát nhanh lớn. Từ 1/8/2025, quy định sẽ được áp dụng đồng loạt với tất cả doanh nghiệp vận chuyển hàng hóa qua đường hàng không, đường bộ và đường sắt.
Theo Bộ Tài chính, mỗi ngày có khoảng 4–5 triệu đơn hàng giá trị nhỏ từ Trung Quốc về Việt Nam qua các sàn thương mại điện tử. Việc thu VAT tự động đối với nhóm hàng này là bước tiến quan trọng trong tăng cường quản lý thương mại điện tử xuyên biên giới, chống gian lận và thất thu thuế.
Miễn thuế nhập khẩu, thuế VAT cho hàng nhập khẩu phục vụ phòng, chống dịch 
Ngăn chặn hàng giả, hàng nhái để cạnh tranh với hàng nhập khẩu 
