Quá trình điều tra được biết, ngày 2/1/2008, HTXVT9 ký hợp đồng với Công ty CP Thương mại & Dịch vụ Cần Giờ (Cagico) và Công ty CP Vật tư xăng dầu (Comeco) để mua dầu DO của 2 đơn vị này, đồng thời ký hợp đồng với Công ty TNHH TM-DV vận tải hàng hóa Hiếu Phương để đơn vị này chuyển dầu DO từ kho của đơn vị bán về kho của Trạm KTHH & DVVT Thủ Đức.
Lợi dụng việc thực hiện hợp đồng trên, sau khi chuyển tiền mua dầu cho Công ty Cagico và nhận hóa đơn, phiếu xuất kho, Hùng giao các phiếu xuất kho cho Công ty TNHH Hiếu Phương đến kho của Công ty Cagico vận chuyển 72.000 lít dầu D.O. Số dầu này, Hùng không nhập về kho của Trạm Thủ Đức mà chiếm đoạt đem bán, thu được 984.240.000đ