Theo đó, Đoàn Thanh tra gồm 5 thành viên, do ông Đỗ Mạnh Hùng - Trưởng phòng Nghiệp vụ 3 (Vụ Thanh tra khối nội chính và kinh tế tổng hợp - Vụ II) làm Trưởng đoàn. Thời kỳ thanh tra là từ 1/1/2012 đến 30/6/2014 và thời gian thanh tra 65 ngày, kể từ ngày công bố quyết định thanh tra. Cũng theo Quyết định của Thanh tra Chính phủ, thành lập Tổ giám sát đoàn thanh tra gồm 3 thành viên.
Đây là hoạt động thanh tra theo chương trình, kế hoạch năm 2014 của Thanh tra Chính phủ đã được Thủ tướng Chính phủ phê duyệt. Cục Thuế TP HCM phụ trách địa bàn có nguồn thu ngân sách chiếm 1/3 cả nước