Trước sự việc trên, dưới sự chỉ đạo trực tiếp của Giám đốc và Thủ trưởng Cơ quan An ninh điều tra Công an tỉnh, Phòng An ninh kinh tế đã phối hợp với Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn tỉnh Thanh Hóa thành lập Đoàn Thanh tra liên ngành tiến hành kiểm tra đột xuất đối với hoạt động kinh doanh phân bón của một số cơ sở kinh doanh phân bón trên địa bàn các huyện Thọ Xuân, Đông Sơn, Thiệu Hóa.
Sau thanh tra, Đoàn công tác đã phát hiện 3 hộ kinh doanh có hành vi vi phạm. Ngày 16/7, Chánh Thanh tra Sở Nông nghiệp và Phát triển nông thôn tỉnh Thanh Hóa đã ra Quyết định xử phạt 3 hộ kinh doanh buôn bán phân bón vi phạm về nhãn hàng hóa và chất lượng với tổng số tiền 162.750.000 đồng.
Trong đó, xử phạt vi phạm hành chính tổng số tiền 67.250.000 đồng, buộc tiêu hủy 6,9 tấn phân bón đang tồn kho là hàng giả về chất lượng đối với hộ kinh doanh Lê Đăng T. (có địa chỉ tại xã Thiệu Phúc, huyện Thiệu Hóa, tỉnh Thanh Hóa); xử phạt vi phạm hành chính các hành vi với tổng mức phạt tiền của các hành vi vi phạm là 84.250.000 đồng, buộc tiêu hủy 3,625 tấn phân bón đang tồn kho là hàng giả về chất lượng đối với hộ kinh doanh Lê Minh H. (có địa chỉ tại xã Đông Hòa, huyện Đông Sơn, tỉnh Thanh Hóa); xử phạt vi phạm hành chính về nhãn hàng hóa với mức phạt tiền là 11.250.000 đồng đối với hộ kinh doanh Lê Thị P. (có địa chỉ tại thị trấn Lam Sơn, huyện Thọ Xuân, tỉnh Thanh Hóa).
Căn cứ hành vi vi phạm, Đoàn Thanh tra đã bàn giao hồ sơ, chuyển vụ việc cho Cơ quan CSĐT Công an huyện Thọ Xuân để tiếp tục điều tra, xử lý theo quy định của pháp luật đối với lô hàng phân bón khối lượng 40,475 tấn là hàng giả về chất lượng tại hộ kinh doanh Lê Thị P.
Khởi tố giám đốc sản xuất buôn bán hơn 76 tấn phân bón giả 
Bắt tạm giam giám đốc sản xuất, buôn bán phân bón giả 
