Trại giam Thủ Đức được Bộ Nội vụ (nay là Bộ Công an) sáp nhập từ trại cải tạo Thủ Đức và trại cải tạo Hàm Tân thuộc tỉnh Thuận Hải cũ (nay là tỉnh Bình Thuận). Đóng quân trên địa bàn vùng sâu vùng xa đầy khó khăn gian khổ đó, hơn 30 năm qua, các thế hệ cán bộ chiến sỹ trại giam Thủ Đức đã vượt qua muôn vàn khó khăn thử thách, làm tròn nhiệm vụ cải tạo, giáo dục phạm nhân, “trả về” cho xã hội hàng ngàn người đã phục thiện, làm lại cuộc đời.
Đồng thời cán bộ chiến sỹ trại Thủ Đức còn cải tạo tự nhiên, thực hiện cuộc "cách mạng xanh", biến 1 vùng đất đồi núi gần 5000 héc ta trở thành một vùng đất đầy sức sống.
Đồng chí Trần Hữu Thông - Giám thị trại giam Thủ Đức - cho biết, mặc dù phạm nhân đông, tư tưởng diễn biến phức tạp nhưng tập thể cán bộ chiến sỹ đơn vị luôn tiến hành đồng bộ các biện pháp nghiệp vụ để làm tốt nhiệm vụ của mình
Đảng ủy - Ban giám thị thường xuyên quan tâm chỉ đạo công tác trinh sát và công tác nghiệp vụ, chỉ đạo Đội trinh sát nắm tình hình phạm nhân, phát hiện và ngăn chặn phạm nhân vi phạm nội quy, quy chế trại giam góp phần bảo vệ trại an toàn trong mọi tình huống, đã phát hiện được 175 vụ - 336 phạm nhân vi phạm nội quy, quy chế trại giam. Phát huy sự tự giác của phạm nhân, Ban Giám thị Trại còn nhận được15 nguồn tin phục vụ công tác đấu tranh phòng chống tội phạm ngoài xã hội, tố giác hành vi mua bán trái phép chất ma túy, tố giác đối tượng đang bị truy nã hay khai báo hành vi phạm tội của bản thân.
Ban Giám thị trại giam Thủ Đức thường xuyên quan tâm đến công tác giáo dục chính trị tư tưởng, ý thức trách nhiệm và tinh thần cảnh giác cho cán bộ chiến sỹ. Mỗi cán bộ chiến sỹ đều nhận thức sâu sắc được rằng, cải tạo những người phạm tội thành những người có ích cho xã hội là nhiệm vụ chính trị cao nhất.
Trong công tác giáo dục cải tạo phạm nhân, Trại thường xuyên quan tâm đến việc ăn, ở, vệ sinh, khám chữa bệnh cho phạm nhân. Phong trào Văn hoá - Văn nghệ - Thể thao được duy trì đều đặn. Đội văn nghệ phạm nhân của trại đã biểu diễn 36 đêm phục vụ cho phạm nhân các phân trại xem, ngoài ra trại còn mời các đoàn văn nghệ trung ương và địa phương đến biểu diễn phục vụ 25 buổi cho 225.000 lượt phạm nhân. Hệ thống truyền hình cáp nội bộ ở các phân trại truyền đến các tivi ở buồng giam những chương trình được chọn lọc và phục vụ cho phạm nhân xem và học tập sau giờ lao động Đội văn nghệ của trại Thủ Đức thường xuyên luyện tập, biểu diễn được hàng chục đêm.
Trại còn tổ chức cho phạm nhân học tập pháp luật, chính trị, thời sự; Tổ chức dạy xóa mù chữ được 14 lớp cho 433 phạm nhân theo học, nghiệm thu và cấp chứng chỉ mức học cho 275 phạm nhân; Tổ chức thi viết, kể chuyện tấm gương đạo đức Hồ Chí Minh cho phạm nhân trong toàn trại; Tổ chức khám, cấp thuốc chữa bệnh cho phạm nhân, đưa đi điều trị tuyến trên cho 608 lượt phạm nhân bị bệnh nặng.
Ngoài ra trại còn tổ chức Hội nghị gia đình phạm nhân, có 250 gia đình phạm nhân đến dự, trại tổ chức cho thân nhân gia đình phạm nhân đến thăm nơi ăn, ở, khu vui chơi giải trí của phạm nhân, qua đó thân nhân gia đình nắm được chính sách khoan hồng nhân đạo của Đảng và Nhà nước đối với người phạm tội, ghi nhận những tình cảm, sự quan tâm của cán bộ chiến sỹ đối với thân nhân và phạm nhân, đồng thời thông qua đó trại phối kết hợp với gia đình phạm nhân làm tốt công tác giáo dục cải tạo con em họ.
Để tạo điều kiện cho phạm nhân yên tâm cải tạo, Ban giám thị luôn quan tâm đến công tác sản xuất, xây dựng và dạy nghề cho phạm nhân. Trại đã tổ chức dạy nghề và truyền nghề cho phạm nhân theo học các nghề như: xây dựng, mộc, rèn, may mặc, đan lát, cạo mủ cao su. chăm sóc rừng trồng, phát triển các ngành nghề thủ công, sử dụng lao động phạm nhân đạt hiệu quả kinh tế cao.
Năm 2009, Trại phát động 2 đợt quyên góp “Quỹ tấm lòng vàng” trong cán bộ chiến sỹ và thân nhân gia đình phạm nhân để giúp đỡ phạm nhân ốm đau bệnh tật hoặc có hoàn cảnh gia đình khó khăn. Trại đã trích từ quỹ sản xuất chi ăn thêm cho phạm nhân ,chi bồi dưỡng và thưởng cho phạm nhân hơn 800 triệu đồng.
Đến nay, Trại đã hoàn thành xây dựng Phân trại Số 2, đập nước Suối Đà; đang tiến hành xây dựng khu nhà làm việc trung tâm. Đơn vị trích từ quỹ sản xuất xây dựng thêm 1 nhà trẻ cho con cán bộ, chiến sỹ trị giá 800 triệu đồng và 68 căn nhà cấp cho cán bộ chiến sỹ trị giá hơn 5 tỷ đồng…
Ban giám thị luôn quan tâm và làm tốt công tác xã hội, giữ mối quan hệ mật thiết với chính quyền và nhân dân địa phương, ủng hộ 5 căn nhà tình thương cho nhân dân xã Tân Đức, thị trấn Tân Minh, huyện Hàm Tân, tỉnh Bình Thuận và 1 căn nhà tình thương cho xã Xuân Hưng, huyện Xuân Lộc, tỉnh Đồng Nai, ủng hộ xây dựng đền thờ tưởng niệm các anh hùng liệt sỹ huyện Hàm Tân, đường giao thông nông thôn thị trấn Tân Minh…
Năm 2009, Trại giam Thủ Đức được Bộ Công an, UBND tỉnh Bình Thuận tặng nhiều Bằng khen. Và vinh dự lớn đến vơi CBCS Trại giam Thủ Đức là ngày 22/12/2009, Chủ tịch nước đã ký Quyết định phong tặng danh hiệu Anh hùng các lực lượng vũ trang nhân dân lần thứ 2 cho đơn vị