Nói cho dễ hiểu, EC giống như cơ quan hành pháp của một quốc gia. Nên sau khi được tái bổ nhiệm làm "Thủ tướng", ông José Manuel Barroso phải đứng ra thành lập "chính phủ mới". Khác với cơ quan hành pháp một quốc gia, thành viên nội các do thủ tướng đề xuất thì trong EC, mỗi nước thành viên trong Liên minh châu Âu (EU) sẽ đề xuất một đại diện làm Ủy viên châu Âu. Mỗi thành viên trong êkíp mới của ông Barroso đều phải trải qua từng phiên chất vấn của EP, rồi cuối cùng EP sẽ bỏ phiếu để quyết định có thông qua danh sách đề cử tổng thể cho EC mới hay không.
Nếu như trước đây, quyền hạn của EP rất hạn hẹp và được ví như cơ quan đại diện "tinh thần", nên việc thông qua các thành viên trong "nội các" EC chỉ mang tính thủ tục, thì nay mọi chuyện hoàn toàn khác. Hiến pháp châu Âu (Hiệp ước
Những khó khăn mà ông Barroso đang gặp phải trong việc thành lập "nội các" mới chính là bắt nguồn từ sự thể hiện uy lực của EP trong vai trò mới. Theo lịch trình, ông Barroso sẽ phải hoàn tất danh sách đề cử EC mới trước ngày 26/1 để EP bỏ phiếu thông qua nay đã phải dời lại ngày 9/2. Lý do của sự đình hoãn này xuất phát từ sự phản đối của EP với ứng cử viên người Bulgary cho chức vụ Ủy viên châu Âu về Hợp tác và Trợ giúp nhân đạo.
Trong phiên chất vấn hôm 18/1, bà Roumiana Jeleva, đương kim Ngoại trưởng Bulgary, ứng cử viên cho chức vụ Ủy viên châu Âu về Hợp tác và Trợ giúp nhân đạo, đã không thuyết phục được các nghị sĩ châu Âu. EP cho rằng bà Jeleva là người thiếu năng lực và lại đang có những rắc rối về tài chính trong nước.
Trong khi ông Barroso còn đang lúng túng chưa biết phải làm sao thì ngày 19/1, bà Jeleva quyết định rút khỏi danh sách đề cử vào EC. Bulgary ngay lập tức thông báo sẽ cử Kristalina Georgieva, hiện là Phó chủ tịch Ngân hàng thế giới, một nhà kinh tế nổi tiếng người Bulgary, làm ứng viên thay thế bà Jeleva. Dự kiến bà Georgieva cũng sẽ bị EP chất vấn trong những ngày tới.
Sự rút lui của bà Roumiana Jeleva đã tránh được một cuộc tranh cãi chính trị giữa các nhóm nghị sĩ trong EP liên quan tới việc chất vấn các ứng cử viên EC nhưng lại làm chậm việc bỏ phiếu thông qua hoạt động của EC nhiệm kỳ mới.
Trước trường hợp của bà Jeleva, EP cũng đã lưỡng lự với ứng cử viên Catherine Ashton, cho chức vụ Trưởng đoàn ngoại giao EU và Phó chủ tịch EC, sau phiên chất vấn đầu tháng 12/2009 tại Bruxelles.
Ngay từ đầu, việc đề cử bà Catherine Ashton vào chức Trưởng đoàn ngoại giao EU đã gây ra nhiều tranh luận trong báo giới EU cũng như trong EP nhưng sau lần chất vấn vừa qua, nhiều nghị sĩ EU đã khiển trách bà Ashton là người thiếu tầm nhìn, thiếu mục tiêu, không biết một ngoại ngữ nào... và nói tóm lại là chưa đáp ứng được những yêu cầu đề ra trong Hiệp ước Lisbon cho chức vụ quan trọng này. Tuy nhiên, khác với trường hợp của ứng viên Bulgary, những toan tính chiến lược của nhóm người có thực quyền tại EU đã giúp cho bà Catherine Ashton trải qua được bài kiểm tra của EP.
Mặc dù vậy, mới đây, hầu hết các nghị sĩ EU thuộc các nhóm khác nhau đều đồng tình khiển trách bà Ashton đã không đi thực tế tới
Ứng cử viên người Bulgary xin rút lui khỏi danh sách đề cử nội các EC mới.
Theo các nghị sĩ châu Âu thuộc nhóm xã hội, có tới không dưới 8 thành viên trong tổng số 26 ứng cử viên trong "nội các" EC mới thiếu năng lực và cam kết cộng đồng. Những nghị sĩ này lo ngại rằng tài năng của những ứng viên hiện nay rất "xoàng", chỉ chăm chút cho những quyền lợi quốc gia và thiếu trầm trọng tham vọng xây dựng một EU lớn mạnh.
Trước sự rút lui của bà Roumiana Jeleva và những lời chỉ trích về năng lực của những ứng viên khác trong danh sách đề cử EC mới, hôm 20/1, Chủ tịch EC José Manuel Barroso đã lên tiếng bảo vệ cho những thành viên "nội các" của mình trước các nghị sĩ châu Âu nhóm họp tại Strasbourg, đồng thời cảnh báo sẽ không xem xét lại thành phần trong ủy ban tương lai của mình.
Giới báo chí châu Âu nhận xét châm biếm rằng, ông Barroso đang lâm vào tình cảnh giống như Tổng thống Hamid Karzai về việc Quốc hội Afghanistan đã hai lần bác danh sách đề cử nội các mới của ông. Nhưng chưa đến nỗi bi đát như Tổng thống Karzai, vì chuyện thành lập "nội các" của ông Barroso mới chỉ vấp phải sự phản đối của Nghị viện châu Âu đối với vài ứng viên, còn đối với ông Karzai là 2/3 danh sách đề cử.
Mọi việc đối với ông Barroso sẽ được quyết định trong phiên bỏ phiếu ngày 9/2 tới. Nếu EP yêu cầu ông Barroso điều chỉnh danh sách thành viên nội các mới - có thể là phủ quyết ứng viên nào đó, hoặc yêu cầu hoán đổi vị trí, thì những cuộc đàm phán phi chính thức sẽ phải được tiến hành ngay. Nói là phi chính thức vì về mặt chính thức thì EP chỉ có thể chất vấn với từng ứng viên rồi sau đó bỏ phiếu phủ quyết hoặc thông qua toàn bộ thành phần của EC chứ không thể phủ quyết đối với từng cá nhân trong danh sách đề cử