Ngày 2/12/2008 UBND tỉnh Đồng Nai đã chấp thuận chủ trương và thỏa thuận địa điểm cho phép Công ty CP Miền Đông - Đầu tư hạ tầng được triển khai dự án KDC phố Bình Dương ở TP Biên Hòa với quy mô hơn 16 ha để tái định cư cho người dân bị giải tỏa khi làm cầu Đồng Nai 2. Ngày 4/6/2009, UBND tỉnh Đồng Nai đã phê duyệt qui hoạch 1/500 và ra quyết định thu hồi đất của các tổ chức, cá nhân giao cho Công ty Miền Đông thực hiện dự án. Sau đó phương án tổng thể về bồi thường, hỗ trợ và tái định cư cho dự án cũng được tỉnh Đồng Nai phê duyệt.
Tuy nhiên, ngày 26/3/2010 UBND tỉnh Đồng Nai đã ra thông báo thu hồi vị trí dự án đã thỏa thuận địa điểm từ Công ty Miền Đông. Ngày 19/4/2010 UBND tỉnh Đồng Nai đã quyết định điều chỉnh tên chủ đầu tư dự án trên từ Công ty Miền Đông thành Công ty CP phát triển hạ tầng An Hưng Phát do ông Nguyễn Minh Hải làm Tổng giám đốc. Chỉ với quyết định này của UBND tỉnh Đồng Nai, Công ty An Hưng Phát đã được kế thừa và làm chủ đầu dự án. Tuy nhiên, từ khi tiếp nhận dự án đến nay, trách nhiệm trả lại khoản tiền đã chi phí bồi thường trước khi được kế thừa dự án đã không được Công ty An Hưng Phát thực hiện.
Cơ quan chức năng đã xác định, đến khi bàn giao dự án cho Công ty An Hưng Phát, Công ty Miền Đông đã bỏ ra chi phí lên tới 16 tỷ đồng để bồi thường cho phần diện tích 1,6 ha của người dân. Trong hơn chục năm đi “đòi” số tiền này từ Công ty An Hưng Phát để trả cho Công ty Miền Đông, các Sở ngành liên quan, UBND TP Biên Hòa, Trung tâm phát triển quỹ đất TP Biên Hòa… đã nhiều lần đôn đốc, chốt thời hạn trả tiền và đã phải trả lời Công ty Miền Đông đến 38 văn bản. Nhưng đến nay, khoản nợ này vẫn “treo” lơ lửng trách nhiệm trên vai UBND TP Biên Hòa.
Ông Nguyễn Minh Hải từng làm Giám đốc Công ty Miền Đông, phụ trách việc bồi thường cho các hộ dân tại dự án KDC phố Bình Dương. Tuy nhiên ngày từ tháng 12/2009, Công ty Miền Đông đã cách chức giám đốc của ông Hải và tố cáo sai phạm của ông Hải đến cơ quan Công an. Trong văn bản trả lời Công ty Miền Đông vào ngày 17/2/2012, Cơ quan Cảnh sát điều tra (CSĐT) Công an tỉnh Đồng Nai đã kết luận: Căn cứ tài liệu đã thu thập, ông Nguyễn Minh Hải đã lập 2 hồ sơ khống trong quá trình thực hiện dự án KDC phố Bình Dương, nâng khống số tiền bồi thường tăng thêm hơn 1,1 tỉ đồng vào thời điểm đó.
Tại dự án KDC ở xã Thạnh Phú, huyện Vĩnh Cửu, Cơ quan CSĐT Công an tỉnh Đồng Nai cũng xác định ông Nguyễn Minh Hải đã tự ý bán 436 nền đất mà không báo cáo với HĐQT Công ty Miền Đông và giá trị chuyển nhượng do ông Hải tự quyết định. Việc này đã gây thiệt hại cho Công ty Miền Đông số tiền 10,6 tỉ đồng. Ngoài ra trong số nền đất ông Hải giao cho sàn giao dịch BĐS chào bán, có đến 42 nền chưa được đền bù giải tỏa, do đó Công ty Miền Đông phải bồi thường cho sàn giao dịch BĐS số tiền hơn 1 tỉ đồng. Cơ quan CSĐT xác định, hành vi của ông Hải đã có đủ cơ sở cấu thành tội lạm dụng tín nhiệm chiếm đoạt tài sản. Sau đó đã có văn bản cũng như chuyển hồ sơ sang Viện kiểm sát nhân dân tỉnh Đồng Nai đề nghị cơ quan này nghiên cứu, thống nhất quan điểm khởi tố vụ án hình sự, khởi tố bị can đối với ông Nguyễn Minh Hải. Tuy nhiên việc này đã không được phía Viện Kiểm sát đồng thuận.
Dù đã bị miễn nhiệm, cách chức giám đốc từ hơn 10 năm trước và không còn tham gia vào HĐQT của Công ty Miền Đông, nhưng ngày 9/1 vừa qua, ông Nguyễn Minh Hải đã đứng ra nộp hồ sơ qua mạng để thay đổi nội dung đăng ký doanh nghiệp của Công ty Miền Đông. Trong đó, ông này còn đăng ký thay đổi người đại diện theo pháp luật của doanh nghiệp và chức danh Chủ tịch HĐQT từ người đương chức sang tên mình. Chỉ bằng một cam kết sẽ tổ chức họp HĐQT để hoàn thiện hồ sơ, Phòng Đăng ký kinh doanh - Sở Kế hoạch và Đầu tư (KHĐT) đã cấp đổi giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp thay đổi lần thứ 9 của Công ty Miền Đông cho ông Hải.
Liên quan đến sự việc này, ngày 9/5 vừa qua ông Nguyễn Hữu Nguyên, Giám đốc Sở KHĐT tỉnh Đồng Nai đã ra quyết định gia hạn giải quyết tố cáo của Công ty Miền Đông đối với ông Phan Huy Toàn - Trưởng phòng Đăng ký kinh doanh. Một nhóm cổ đông của Công ty Miền Đông cũng đã có đơn tố cáo ông Phan Huy Toàn về hành vi “Lợi dụng chức vụ trong khi thi hành công vụ” gửi Cơ quan CSĐT Công an tỉnh Đồng Nai. Sau khi tiếp nhận và thụ lý vụ việc Công ty Miền Đông khởi kiện Giám đốc Sở KHĐT và Trưởng phòng Đăng ký kinh doanh, TAND tỉnh Đồng Nai đã ra quyết định buộc Phòng đăng ký kinh doanh và người liên quan phải tạm đình chỉ thi hành Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp thay đổi lần thứ 9 đã cấp cho Công ty Miền Đông.
Để tránh việc tiếp tục gây ảnh hưởng đến quyền lợi người mua nhà, đất tại dự án của 2 doanh nghiệp trên, các cơ quan chức năng cần sớm làm rõ vụ việc.
Làm rõ các sai phạm tại dự án khu dân cư gần 48 ha theo yêu cầu của Thanh tra Chính phủ 
Thanh tra Chính phủ chỉ ra sai phạm tại dự án của Công ty D2D 
