Cái chết đáng ngờ của Karegeya - được cho là bị siết cổ đến chết - xảy ra sau một loạt các vụ ám sát khác được thực hiện theo lệnh của Tổng thống Rwanda - theo tuyên bố của Theogene Rudasingwa thuộc đảng liên minh đối lập Quốc hội Dân tộc Rwanda (RNC).
Nữ trung tá Katlego Mogale, người phát ngôn cho lực lượng Cảnh sát Nam Phi, báo cáo: "Patrick Karegeya được phát hiện nằm chết trên giường trong một căn phòng khách sạn hạng sang. Cảnh sát cũng tìm thấy một chiếc khăn nhuốm máu và sợi dây thừng cất trong két sắt phòng khách sạn. Có khả năng cựu Giám đốc Tình báo Rwanda bị siết cổ đến chết".
Trung tá Mogale cho biết, nạn nhân Karegeya, 53 tuổi, bay đến Nam Phi sống lưu vong từ năm 2007 sau khi bị cho là âm mưu đảo chính lật đổ Tổng thống Kagame và cuộc điều tra về cái chết bất thường của ông đang được tiến hành.
Theo Cao ủy Rwanda Vincent Karega, Đài Truyền hình địa phương NCA nhận định đây là vụ ám sát có liên quan đến chính trị và mang tính cơ hội. Karega kêu gọi mọi người bình tĩnh chờ đợi kết luận cuối cùng từ Cảnh sát Nam Phi. Trước đây, Trung tướng Kayumba Nyamwasa - cựu Tham mưu trưởng quân đội của Tổng thống Paul Kagame - cũng bị các tay súng lạ mặt hai lần cố giết chết khi ông đang sống lưu vong ở thành phố Johannesburg của Nam Phi năm 2010.
Năm 2012, Nyamwasa nói với Hãng thông tấn Associated Press (AP) rằng, Tổng thống Kagame liên tục "sử dụng những đội sát thủ thuê" săn lùng ông cùng với những nhân vật đối lập khác trên khắp thế giới để trừ khử. Vào ngày 30/11/2013, cựu Giám đốc Tình báo Rwanda Patrick Karegeya, nói với một phóng viên AP rằng, ai chống đối Tổng thống Kagame tất yếu sẽ phải trả giá bằng mạng sống.
Karegeya cho biết gia đình ông cũng bị khủng bố - đơn cử trường hợp hộ chiếu Rwanda của con gái ông bị thu hồi theo lệnh của Tổng thống Kagame khi cô đang cố rời khỏi Uganda. Thậm chí, Karegeya cũng bị Tổng thống Rwanda gây cản trở khi ông tìm kiếm việc làm ở tổ chức Liên Hiệp Quốc. Năm 2011, Tòa án quân sự Rwanda xử vắng mặt 20 năm tù đối với Karegeya và Nyamwasa cùng với 2 sĩ quan khác vì tội đe dọa an ninh quốc gia.
Những người Rwanda sống lưu vong thuộc bộ tộc Tutsi của Tổng thống Kagame cho biết, cảnh sát Anh, Mỹ và Bỉ thường xuyên cảnh báo những người này rằng chính quyền của họ có âm mưu giết chết họ. Hai người Rwanda lưu vong cũng cho biết họ nhận được cảnh báo từ Sở Cảnh sát Anh rằng chính chính quyền Rwanda "đặt mối đe dọa sắp tới" cho mạng sống của họ. Lúc đó, chính quyền Tổng thống Kagame liền phát đi tuyên bố rằng "chính quyền Rwanda không bao giờ đe dọa mạng sống của công dân nước này cũng như không sử dụng bạo lực chống người dân ở bất cứ nơi nào họ đang sống".
Năm 2012, Thụy Điển trục xuất các nhà ngoại giao Rwanda vì hành vi gián điệp; và trong cùng thời gian, chính quyền Bỉ cũng có hành động trục xuất tương tự vì các hoạt động mâu thuẫn với tư cách nhà ngoại giao của những người này.
Tổng thống Kagame từ lâu đã bị buộc tội liên quan đến những vụ giết người bên ngoài biên giới Rwanda. Năm 1996, cựu Bộ trưởng Nội vụ Seth Sendashonga và doanh nhân Augustin Bugirimfura bị bắn chết tại thủ đô Nairobi của Kenya. Ngay sau đó, chính quyền Kenya cho bắt giam một nhà ngoại giao Rwanda nhưng lại thả ngay do sức ép từ Tổng thống Kagame.
Cũng ở Nairobi, nhà lập pháp và cựu quan chức tình báo cao cấp Theoneste Lizinde của Rwanda bị ám sát vào năm 1998. Năm 2000, cố vấn Tổng thống Assiel Kabera, được cho là bị nhóm người mặc quân phục bắn chết ở thủ đô Kigali của Rwanda.
Những vụ ám sát liên tiếp như thế đã dẫn đến làn sóng chống đối mạnh mẽ chính quyền Tổng thống Kagame. Karegeya và Nyamwasa nằm trong số 4 cựu sĩ quan quân đội Rwanda - tất cả đều thuộc bộ tộc thiểu số Tutsi của Tổng thống Kagame - đã thành lập một đảng đối lập lưu vong vào năm 2000. Mặt trận Ái quốc Rwanda của Kagame nắm quyền lực vào năm 1994 khi tội ác diệt chủng ở nước này kết thúc, với khoảng 800.000 người Tutsi và Hutu bị giết chết.
Ngày nay, Rwanda có một số tiến bộ về y tế và giáo dục đồng thời là trung tâm công nghệ, Nhưng, Rudasingwa than phiền cộng đồng quốc tế đang nhắm mắt làm ngơ trước những vụ ám sát của chính quyền. Rudasingwa và những người khác tuyên bố năm 1994 chính Tổng thống Kagame đã ra lệnh bắn rơi chiếc máy bay đang chở hai tổng thống của Rwanda và Burundi láng giềng.
Theo Báo cáo năm 2010 của Liên Hiệp Quốc, Kagame từ chối những cuộc đàm phán hòa bình khi hàng ngàn người Tutsi của Rwanda bị giết chết và kéo dài thời gian để lực lượng vũ trang của ông tiến đến Kigali và nắm quyền kiểm soát thủ đô. Báo cáo cũng nêu lên vai trò của quân đội Mỹ trong việc huấn luyện quân đội của Kagame.
Rudasingwa cho rằng sự ủng hộ của quốc tế đối với Tổng thống Kagame hiện nay đang giúp "đẩy Rwanda vào một cuộc xung đột đẫm máu khác nhưng cộng đồng quốc tế lại có vẻ như không quan tâm đến việc ngăn chặn vụ tắm máu khác ở Rwanda"
