Dự án vào giai đoạn nước rút, nhưng đến nay vẫn còn 14 trường hợp bị ảnh hưởng từ dự án trong giai đoạn 1 dù đã được bồi thường nhưng chưa bàn giao mặt bằng hoặc tái lấn chiếm diện tích đã thực hiện bồi thường, hỗ trợ, tái định cư. Ngoài ra, trong phạm vi thi công của dự án hiện còn 2 tuyến cáp ngầm và 62 trụ điện chưa được di dời.
Thời gian gần dây, dự án có nhu cầu sử dụng cát để đắp nền đường và một số hạng mục công trình như xử lý gia cố sau kè với khối lượng khoảng 1,4 triệu m3, nhưng do khan hiếm nguồn cát dẫn tới giá vật liệu cát tăng cao so với giá vật liệu tại thời điểm lập hồ sơ dự thầu. Điều này khiến các nhà thầu thi công hạng mục đường giao thông và hạ tầng kỹ thuật đang gặp khó khăn về nguồn cung cấp cát dẫn tới chậm tiến độ thi công.
Đối với loại vật liệu đá mi, đá dăm các loại, dự án cần khoảng 755.300m3 nhưng hiện thành phố và các tỉnh trong khu vực đang tập trung thi công đồng loạt các dự án trọng điểm dẫn đến việc khan hiếm nguồn cung các loại làm ảnh hưởng trực tiếp đến tiến độ thi công.
Trước đó, ngày 23/6, UBND tỉnh Đồng Nai đã chỉ đạo bổ sung khai thác đá xây dựng phục vụ Dự án Tham Lương - Bến Cát - rạch Nước Lên với khối lượng 242.000 m3 đá các loại cho Công ty Hồng An. Để giải quyết tình trạng trên, ngày 27/6 Ban Hạ tầng đã đề nghị Sở NNMT các tỉnh Tây Ninh, Đồng Nai, Trà Vinh, Sóc Trăng, Tiền Giang, Đồng Tháp, Vĩnh Long, An Giang, Hậu Giang, Kiên Giang (cũ) hỗ trợ cung cấp nguồn đá phục vụ thi công các dự án công trình trọng điểm do Ban Hạ tầng làm chủ đầu tư.
Tuy vậy, hiện dự án Tham Lương - Bến Cát - rạch Nước Lên vẫn chủ yếu phải sử dụng nguồn cát nhập khẩu và từ 2 mỏ cát ở Bến Tre. Đến nay nguồn cát đã đưa về công trường cũng chỉ đạt 250.000 m3, tương ứng với 16% tổng lượng sử dụng cho dự án; đá các loại cũng mới đạt 120.000 m3, bằng 16%.
Trước thực trạng trên, Ban Hạ tầng đã kiến nghị UBND thành phố chỉ định các mỏ đá ở Bình Dương cấp cho dự án nhằm tháo gỡ khó khăn về vật liệu cho các nhà thầu. Ngoài ra UBND thành phố hỗ trợ, đề nghị các tỉnh Tây Ninh, Đồng Nai, Đồng Tháp, Vĩnh Long, An Giang, Cần Thơ hỗ trợ cung cấp nguồn đá phục vụ thi công các dự án công trình trọng điểm do Ban Hạ tầng làm chủ đầu tư.
Mặc dù đã xác định được 13 vị trí bãi đổ tiếp nhận bùn, đất dư từ quá trình thi công các gói thầu, các bải đổ bùn đất thải này đã được địa phương thống nhất, các sở ngành hỗ trợ giải quyết nhưng đến nay Ban Hạ tầng vẫn đang tiếp tục làm việc với các địa phương về pháp lý với bãi đổ tại dự án Tiểu khu 3 ở khu vực Bình Tân và Công viên văn hóa Gò Vấp. Riêng 10 vị trí bãi đổ tại khi vực quận 12 cũ, hiện mới dừng ở mức chờ Sở NNMT chấp thuận.
Trong khi đó dự án đã thi công hơn phân nửa khối lượng, lượng bùn, đất ô nhiễm rất lớn đào lên trong quá trình thi công các hạng mục công trình ven kênh đã được xử lý ra sao là vấn đề cần làm rõ.
Xung quanh việc chấm thầu và trúng nhiều gói thầu sát giá ở Dự án kênh Tham Lương 
Những ai "gánh" pháp lý đầu tư, chấm điểm nhà thầu ở Dự án kênh Tham Lương? 
