Trung tâm có quyết định thành lập từ ngày 10/11/2011, đặt tại Bệnh viện Việt - Đức (Hà Nội). Trung tâm có chức năng tổ chức thực hiện việc điều phối về hiến, lấy và ghép mô, bộ phận cơ thể người giữa các ngân hàng mô và các cơ sở y tế trong phạm vi cả nước.
Tại buổi lễ, Bộ trưởng Bộ Y tế Nguyễn Thị Kim Tiến nhấn mạnh, sự ra đời của Trung tâm là dấu ấn quan trọng góp phần nâng cao sức khỏe cho nhân dân. Hiện nay tại Việt Nam nhu cầu ghép tạng của người dân rất lớn. Theo thống kê của Bộ Y tế, cả nước có khoảng 6.000 người suy thận có nhu cầu ghép thận, 1.500 người cần ghép gan và 5.000 người có nhu cầu ghép giác mạc. Trong khi đó, mỗi năm Bệnh viện Việt - Đức có khoảng 1.000 người chết não nhưng số người hiến bộ phận cơ thể rất ít.
Bởi vậy, sự ra đời của trung tâm là cầu nối giữa người có nhu cầu với người hiến bộ phận cơ thể người, giúp nhiều người có thêm cơ hội sống. Cũng trong buổi lễ, đại diện Bộ Y tế đã công bố quyết định thành lập Ban chỉ đạo quốc gia về hiến, ghép mô, bộ phận cơ thể người do Bộ trưởng Bộ Y tế làm Trưởng ban