Theo quyết định, Ban Chỉ đạo có trách nhiệm: Tổ chức tập huấn, hướng dẫn nghiệp vụ thanh tra chuyên đề mua sắm trang thiết bị, vật tư y tế, sinh phẩm, kit xét nghiệm, vaccine, thuốc phòng, chống dịch COVID-19 cho các vụ, cục thuộc Thanh tra Chính phủ và Thanh tra bộ, Thanh tra tỉnh theo đề cương hướng dẫn của Thanh tra Chính phủ. Ban Chỉ đạo có trách nhiệm chỉ đạo, đôn đốc hoạt động thanh tra chuyên đề mua sắm trang thiết bị, vật tư y tế, sinh phẩm, kit xét nghiệm, vaccine, thuốc phòng, chống dịch COVID-19 của Thanh tra Chính phủ, Thanh tra bộ, Thanh tra tỉnh tiến hành thanh tra theo đúng mục đích, yêu cầu, bảo đảm chất lượng, đúng tiến độ đề ra; chỉ đạo việc tổng hợp và xây dựng báo cáo kết quả thanh tra trên phạm vi toàn quốc trình Tổng Thanh tra Chính phủ; giúp Tổng Thanh tra Chính phủ xây dựng báo cáo trình Thủ tướng Chính phủ và Ủy ban Thường vụ Quốc hội. Ban Chỉ đạo thanh tra chuyên đề do ông Trần Văn Minh, Phó Tổng Thanh tra Chính phủ làm Trưởng ban.
Đồng thời, Thanh tra Chính phủ thành lập Tổ Công tác để giúp Ban Chỉ đạo đôn đốc, tổng hợp kết quả thanh tra chuyên đề mua sắm trang thiết bị, vật tư y tế, sinh phẩm, kit xét nghiệm, vaccine, thuốc phòng, chống dịch COVID-19. Ồng Lê Hồng Lĩnh, Vụ trưởng Vụ III, Thanh tra Chính phủ làm Tổ trưởng Tổ Công tác.
Tổ Công tác có nhiệm vụ tham mưu Ban Chỉ đạo thực hiện các nhiệm vụ đã nêu trên; giúp Ban Chỉ đạo tổng hợp và xây dựng báo cáo kết quả thanh tra chuyên đề mua sắm trang thiết bị, vật tư y tế, sinh phẩm, kit xét nghiệm, vaccine, thuốc phòng, chống dịch COVID-19 trên phạm vi toàn quốc để báo cáo Ban Chỉ đạo và giúp Ban Chỉ đạo xây dựng báo cáo Tổng Thanh tra Chính phủ.
Trước đó, theo báo cáo của Thanh tra Chính phủ, cơ quan thanh tra đã ban hành nhiều văn bản chỉ đạo thực hiện nghị quyết của Chính phủ. Thanh tra Chính phủ đã tham mưu Thủ tướng Chính phủ phê duyệt định hướng chương trình thanh tra năm 2022. Trong đó có kế hoạch thanh tra việc mua sắm trang thiết bị y tế, sinh phẩm, kit xét nghiệm phục vụ phòng, chống dịch vừa qua để chống lãng phí, tiêu cực, lợi ích nhóm.
Đáng chú ý, Chính phủ giao cơ quan thanh tra tiến hành thanh tra việc mua sắm trang thiết bị y tế, sinh phẩm, kit xét nghiệm phục vụ phòng, chống dịch COVID-19 tại Bộ Y tế, UBND thành phố Hà Nội, thành phố Hồ Chí Minh. Thanh tra đã xây dựng, phê duyệt 3 cuộc thanh tra này. Thanh tra Chính phủ cho biết sẽ triển khai các cuộc thanh tra nói trên ngay trong quý I-2022. Đồng thời, Thanh tra Chính phủ cũng theo dõi, đôn đốc, hướng dẫn các đơn vị liên quan tổng hợp kết quả thanh tra và báo cáo Thủ tướng.
Cơ quan thanh tra cũng tham mưu Chính phủ chỉ đạo các bộ, ngành, địa phương thanh tra việc quản lý, sử dụng nguồn kinh phí hỗ trợ, việc mua sắm trang thiết bị y tế phục vụ công tác phòng, chống dịch. Thanh tra Chính phủ cũng có văn bản hướng dẫn các bộ, ngành, địa phương xây dựng kế hoạch thanh tra năm 2022, trong đó có nội dung thanh tra liên quan việc mua sắm trang thiết bị y tế phục vụ công tác phòng, chống dịch COVID-19.
Mua sắm vật tư y tế phòng, chống dịch phải công khai, minh bạch 
Kiểm tra việc mua sắm kit xét nghiệm COVID-19 tại TP Hồ Chí Minh 
