Theo cáo trạng: Năm 2002, Hải đi xuất khẩu lao động tại Cộng hòa Séc và quen biết Nguyễn Đức Chơm, quê ở tỉnh Thái Bình. Cuối năm 2010, Chơm về nước, đưa theo 2 công dân Cộng hòa Séc cùng về. Hai công dân người nước ngoài này đã truyền bí quyết sản xuất ma túy cho Chơm, Hải và Đỗ Văn Dũng (người quen của Hải).
Tháng 4/2011, Chơm về Thái Bình để sản xuất ma túy. Hải cũng đã về quê của Chơm để nắm vững thêm công thức pha chế và đúc rút thêm kinh nghiệm sản xuất ma túy đá. Khi đã nắm chắc bí quyết, Hải đã về nhà bố mẹ đẻ tại đường Nguyễn Cảnh Chân, phường Quang Trung, TP Vinh để sản xuất ma túy. Theo thỏa thuận giữa Hải và Chơm, Hải sẽ tìm mua nguyên liệu để sản xuất ma túy đá dạng thô, sau đó giao lại để Chơm tinh chế ma túy hàm lượng cao hơn rồi chuyển ra nước ngoài tiêu thụ.
Đầu tháng 6/2011, lợi dụng việc bà Nga (mẹ Hải) đi nước ngoài chữa bệnh; bố sống ly thân tại xã Bắc Sơn, huyện Đô Lương thỉnh thoảng mới về TP Vinh nên nhà không có người ở. Hải ra Hà Nội tìm mua các loại tân dược chữa bệnh cảm cúm và một số hóa chất, trị giá khoảng 100 triệu đồng, rồi thuê ôtô khách vận chuyển nhiều lần về nhà bố mẹ đẻ để làm nguyên liệu, phụ gia sản xuất ma túy.
Theo lời khai của Hải, trong tháng 8 và tháng 9/2011, Hải đã sản xuất 2 đợt được 500 gam ma túy để giao cho Chơm và tiếp tục sản xuất theo "đặt hàng" của Chơm.
Đầu tháng 12/2011, bà Nga từ nước ngoài về, nghi ngờ Hải sản xuất ma túy nên đã can ngăn, nhưng Hải không nghe. Đáng lẽ, bà Nga phải chủ động tố giác với cơ quan Công an, nhưng lại bỏ mặc việc làm của Hải nên phải chịu trách nhiệm về hành vi không tố giác tội phạm. Đối với ông Lê Khắc Minh, cũng phát hiện Hải sản xuất ma túy, ông Minh đã can ngăn nhưng Hải không nghe nên đã chiều theo việc làm của Hải.
Sáng 29/3/2012, ông Minh từ Đô Lương về căn nhà tại đường Nguyễn Cảnh Chân, TP Vinh, được Hải nhờ ngồi bóc tách các vỉ thuốc tây để sản xuất ma túy. Ông Minh đã ngồi bóc tách giúp con, mẻ này đã sản xuất ra 63,2 gam ma túy, ông Minh phải chịu trách nhiệm hình sự về việc tham gia sản xuất số ma túy trên.
Riêng bị can Tăng Thị Lan Phương là người có quan hệ tình cảm với Hải. Ngày 20/3/2012, một đối tượng liên lạc với Hải để mua ma túy. Hải đã về nhà bố mẹ đẻ lấy một ít ma túy chưa sấy mang về nơi ở của Phương để sấy nóng. Phương biết và đồng ý với việc làm vi phạm pháp luật của Hải. Số lượng ma túy này cân nặng 8 gam, được Hải bán với giá 6,4 triệu đồng. Hành vi của Tăng Thị Lan Phương là đồng phạm với Hải.
Ngày 30/3/2012, cơ quan Công an tỉnh Nghệ An đã bắt khẩn cấp Lê Thanh Hải và khám xét một số địa điểm liên quan đến việc sản xuất ma túy, đã thu 1.300 gam chất kết tinh màu trắng, một số tân dược cùng nhiều dụng cụ, phương tiện khác phục vụ cho việc sản xuất trái phép chất ma túy đá.
Như vậy, bi kịch của một gia đình dẫn tới bố, mẹ, người thân cùng bị truy tố trước pháp luật xuất phát từ việc thiếu kiên quyết, nhu nhược trước việc làm sai trái của con mình. Mặc dù là người ruột thịt, thân thiết, nhưng nếu những người thân của Hải chủ động tố giác với cơ quan pháp luật thì không phải "giết" Hải, mà là "cứu" Hải. Việc tố giác ngoài việc không bị liên lụy cho bản thân và những người khác; còn chặn đứng việc lấn sâu vào tội lỗi của Hải. Chặn sớm ngày nào, lượng ma túy sản xuất ít đi ngày đó, thì tội của Hải cũng sẽ nhẹ hơn.
Với Nguyễn Đức Chơm và Đỗ Văn Dũng, cơ quan Công an đã tách ra để xử lý trong một vụ án khác