Theo chủ trương của Thành ủy và UBND TP Hà Nội, Trung tâm đào tạo công nghệ thông tin đã lập đề cương dự toán chi tiết hạng mục đào tạo, bồi dưỡng cán bộ, công chức năm 2010. Từ tháng 5 đến tháng 12/2010, trung tâm tổ chức các khóa đào tạo, ký hợp đồng và lập chứng từ đề nghị Kho bạc nhà nước quận Thanh Xuân thanh toán hơn 2,1 tỷ đồng.
Hùng, Khánh và Nga đã tổ chức lập chứng từ khống nhằm thu lợi bất chính. Dưới sự chỉ đạo của Hùng, trung tâm đã thanh toán khống trong một số hợp đồng thuê thiết bị học tập, tổ chức đào tạo, biên soạn giáo trình, mua văn phòng phẩm, photo tài liệu với 18 công ty, chủ doanh nghiệp.
Trung tâm ký hợp đồng thuê 13 giảng viên với tổng giá trị hợp đồng lập khống hơn 100 triệu đồng, thậm chí cả tiền ăn cho các học viên cũng bị lập khống lên hơn 100 triệu đồng… Quá trình điều tra xác định, ba đối tượng đã lập chứng từ thanh toán khống để đút túi 515 triệu đồng