Ông Nguyễn Văn Du, Giám đốc Bảo tàng Đồng Nai cho biết: Tình trạng ô nhiễm môi trường và xây quá nhiều đập thủy điện trên hệ thống sông Đồng Nai là một trong những nguyên nhân dẫn đến nhiều loài cá đặc hữu của dòng sông này đang đứng bên bờ vực tuyệt chủng. Nếu như trước đây trên sông Đồng Nai, ngư dân thường bắt gặp những loài cá như cá ngựa xám, ngựa xương, cá cóc đậm, các loài cá trèn, những loài thuộc họ cá lăng và cá chạch sông… thì nhiều năm trở lại đây, những loài đặc hữu này rất hiếm khi gặp.
Từ năm 2006, Bảo tàng Đồng Nai được sự giúp sức của Chi cục Khai thác và Bảo vệ nguồn lợi thủy sản Đồng Nai thực hiện việc sưu tầm và nghiên cứu để bảo tồn giống, nguồn gen và các mẫu cá của dòng sông này. Đến nay, bộ sưu tập đã có trên 1.000 con thuộc 84 loài khác nhau.
Theo điều tra, nghiên cứu của các chuyên gia về thủy sinh, trên hệ thống sông Đồng Nai có khoảng 300 loài cá, trong đó có 17 loài nằm trong Sách đỏ Việt Nam ở các mức độ khác nhau, cần được bảo vệ
