Quá trình điều tra có căn cứ kết luận: Bị can Thoa đã cùng Lê Hòa Bình, nguyên Chủ tịch HĐQT Công ty CP Xây dựng và Dịch vụ 1-5 (Công ty 1-5) đưa tiền chênh lệch giá từ việc bán cổ phần là giá trị đất tại dự án Nam Đàn Plaza thấp hơn giá thỏa thuận cho những đối tượng liên quan; nhưng việc đàm phán, ký kết và thanh toán đều do Lê Hòa Bình quyết định và chỉ đạo thực hiện.
Quá trình triển khai có sự chỉ đạo của bị can Lê Hòa Bình, bị can Thoa biết có "liên minh ma quỷ" trong việc hạ giá cổ phần thấp hơn giá thỏa thuận để lấy tiền chia nhau nhưng không tố giác với cơ quan chức năng. Vì vậy, không có cơ sở kết luận bị can Thoa đồng phạm với các bị can khác về tội "Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ". Tuy nhiên, do có biết hành vi phạm tội của các bị can mà không tố giác, nên bị can Thoa phải chịu trách nhiệm về hành vi "Không tố giác tội phạm".
Với bị can Hương, cơ quan điều tra xác định bị can này không liên quan đến việc đàm phán về giá chuyển nhượng cổ phần giữa Công ty CP Xây dựng Minh Ngân và Công ty CP Bất động sản điện lực dầu khí Việt
Quá trình điều tra bổ sung, cơ quan CSĐT Bộ Công an đã tiến hành xác minh lời khai của các bị can trong việc thông qua bị can Hương chuyển khoản tiền chênh lệch từ việc gian dối mua bán cổ phần cho ông Trịnh Xuân T. và Đinh Mạnh Th., là Chủ tịch HĐQT và Giám đốc của hai doanh nghiệp. Nhưng cả ông Trịnh Xuân T. và Đinh Mạnh Th. đều không biết, không tham gia, thỏa thuận gì về việc chuyển nhượng cổ phần tại Công ty CP Bất động sản điện lực dầu khí Việt Nam. Cả hai ông này cũng không hiểu vì sao các bị can lại có ý định chuyển tiền cho họ!?
Cơ quan CSĐT Bộ Công an giữ nguyên quan điểm đề nghị truy tố bị can Nguyễn Thị Kim Thoa và bị can Thái Kiều Hương về hành vi "Không tố giác tội phạm". Ngoài ra, bị can Thoa còn phải chịu trách nhiệm về hành vi "Lừa đảo chiếm đoạt tài sản" cùng bị can Lê Hòa Bình và bị can Nguyễn Mạnh Cường, nguyên Tổng Giám đốc Công ty 1-5.
Trong vụ án này, cơ quan CSĐT - Bộ Công an đã đề nghị truy tố 8 bị can, chủ yếu là những nhân vật chủ chốt của một số doanh nghiệp.
Như vậy, trong vụ án lừa đảo chiếm đoạt tài sản, lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ, không tố giác tội phạm xảy ra tại Công ty 1-5, Công ty CP Bất động sản điện lực dầu khí Việt Nam, số tài sản bị chiếm đoạt là hơn 801 tỷ đồng; có 429 bị hại nộp tiền giao vốn cho Công ty 1-5.
Đến nay, Công ty 1-5 đã hoàn trả hơn 578 tỷ đồng cho các bị hại, trong đó bị can Lê Hòa Bình là chủ mưu cầm đầu; Nguyễn Thị Kim Thoa chịu trách nhiệm hơn 653 tỷ đồng đã ký duyệt phiếu chi; Nguyễn Mạnh Cường, nguyên Tổng Giám đốc Công ty 1-5 đã không thông báo cho người dân biết Cienco 5 Land đã chấm dứt hợp đồng dự án đất Thanh Hà với Công ty 1-5 nên hàng trăm người dân đã tin tưởng ký hợp đồng giao vốn và nộp tiền cho Công ty 1-5 để mua nhà.
Theo đó ông Cường đã ký 7 hợp đồng giao vốn và thu hơn 12 tỷ đồng... ông Đào Duy Phong nguyên Chủ tịch HĐQT Công ty CP Bất động sản điện lực dầu khí Việt Nam chiếm hưởng 10 tỷ đồng; ông Đặng Sĩ Hùng, nguyên Trưởng phòng Kinh tế - Kế hoạch (dưới quyền ông Phong) chiếm hưởng 20 tỷ đồng; ông Huỳnh Nguyễn Quốc Duy chiếm hưởng 11 tỷ đồng trong việc mua bán cổ phiếu