Theo công điện, Chủ tịch UBND thành phố yêu cầu Giám đốc Sở Y tế, Sở Thông tin và Truyền thông, Sở Giáo dục và Đào tạo, Sở Nông nghiệp và PTNT và Giám đốc, thủ trưởng các sở, ban, ngành, đoàn thể thành phố và Chủ tịch UBND các quận, huyện, thị xã tiếp tục duy trì và phát động phong trào “Vệ sinh yêu nước” do Chủ tịch Hồ Chí Minh kêu gọi tới các thôn xóm, cụm dân cư và từng người dân; tổ chức chiến dịch rửa tay bằng xà phòng, vệ sinh môi trường loại bỏ loăng quăng, bọ gậy tại khu vực sinh sống và làm việc trong tháng 9/2012.
Sở Y tế - Cơ quan thường trực Ban chỉ đạo phòng, chống dịch bệnh TP Hà Nội phối hợp với các cơ quan liên quan của Bộ Y tế và các sở, ban, ngành, đoàn thể, UBND các quận, huyện, thị xã, chỉ đạo hệ thống y tế các tuyến xây dựng kế hoạch cụ thể, tăng cường giám sát, chẩn đoán phát hiện sớm, kịp thời cấp cứu, tích cực điều trị, hạn chế thấp nhất tổn thất tính mạng và sức khoẻ người dân; chuẩn bị sẵn sàng cơ số thuốc, vật tư trang thiết bị y tế, hoá chất thiết yếu, khu vực cách ly để kịp thời thu dung bệnh nhân; cách ly, khoanh vùng xử lý triệt để, không để dịch lây lan. Chủ động hỗ trợ chuyên môn, vật chất cho các tuyến y tế trực thuộc để tăng cường kiểm tra, kiểm soát dịch bệnh trên địa bàn. Phân công các đơn vị theo dõi, triển khai công tác phòng chống dịch tại các quận, huyện, xã, phường. Kịp thời báo cáo UBND thành phố và Bộ Y tế đầy đủ tình hình diễn biến dịch bệnh trên địa bàn thành phố.
Sở Giáo dục và Đào tạo phối hợp với Sở Y tế, UBND các quận, huyện, thị xã hướng dẫn các trường học trên địa bàn tổ chức các buổi nói chuyện trực tiếp với phụ huynh học sinh về biện pháp và cách nhận biết sớm dấu hiệu các bệnh, dịch để chủ động phòng, chống. Phối hợp chặt chẽ với ngành y tế trong việc quản lý sức khoẻ học sinh, chủ động thông báo ngay cho các đơn vị y tế khi phát hiện có trường hợp mắc bệnh để xử lý kịp thời.
Sở Nông nghiệp và PTNT phối hợp chặt chẽ với UBND các quận, huyện, thị xã, các sở, ban, ngành, đoàn thể liên quan tiếp tục thực hiện Công điện số 09/CĐ-UBND ngày 03/8/2012 của UBND thành phố; tổ chức tốt việc quản lý, kiểm tra, giám sát chặt chẽ dịch bệnh trên đàn gia cầm. Kịp thời xử lý triệt để ổ dịch, phòng lây nhiễm cúm A (H5N1) từ gia cầm sang người.