Nhà ga Shinjuku tọa lạc ở quận cùng tên thuộc khu trung tâm hành chính của thủ đô Tokyo, cũng là nơi sinh trưởng của cố Thủ tướng Nhật Bản Shinzo Abe (1954-2022).
Ga đường sắt Shinjuku được khánh thành gần 1,4 thế kỷ trước, vào năm 1885 để làm điểm dừng trên tuyến tàu điện ngầm Akabane-Shinagawa. Theo thời gian, nhà ga trở thành điểm dừng chính cho khu trung tâm Tokyo, đồng thời là điểm trung chuyển cho 8 tuyến metro xuyên tâm khác khiến lượng hành khách đi lại hàng ngày tăng vọt.
Tính đến thời điểm hiện nay, nhà ga khổng lồ này có tổng cộng 209 cửa ra hoặc vào riêng biệt, 53 sân chờ bao gồm cả các tầng trên mặt đất và tầng ngầm, cùng với mạng lưới hành lang nội bộ dày đặc nối các sân chờ, khiến hành khách không phải ra khỏi nhà ga nếu muốn chuyển sang tuyến metro khác.
Mỗi trục đường ray trong ga đều có bệ sàn riêng biệt ở hai bên dành cho việc lên hoặc xuống tàu, tránh tình trạng chen lấn xô đẩy mất an toàn.