Theo đó, liên quan đến việc UBND TP Hà Nội và UBND huyện Hoài Đức thực hiện công tác quản lý nhà nước về đất đai tại dự án Khu đô thị Kim Chung- Di Trạch, huyện Hoài Đức và việc chủ đầu tư dự án chấp hành các quy định của pháp luật về quản lý, sử dụng đất, kết luận thanh tra nêu rõ, về quy hoạch xây dựng, thời gian lập, thẩm định, trình phê duyệt Quy hoạch phân khu S2 của TP kéo dài từ tháng 10/2010 đến tháng 1/2014 vi phạm quy định của Nghị định số 37/2010/NĐ-CP về lập, thẩm định, phê duyệt và quản lý quy hoạch đô thị. Việc điều chỉnh tổng thể Quy hoạch chi tiết tỷ lệ 1/500 kéo dài từ tháng 3/2014 đến tháng 10/2018 vi phạm quy định Nghị định số 37/2010/NĐ-CP.
Về công tác giải phóng mặt bằng, theo kết luận thanh tra, sau 3 tháng kể từ khi có quyết định thu hồi đất tổng thể, UBND huyện Hoài Đức mới ban hành quyết định thu hồi đất đến từng hộ gia đình, cá nhân là không đúng quy định của Nghị định số 84/2007/NĐ-CP. Hội đồng bồi thường giải phóng mặt bằng huyện Hoài Đức không ban hành thông báo thu hồi đất đến từng hộ gia đình, cá nhân (104 hồ sơ được kiểm tra đều thiếu thông báo thu hồi đất) là không đúng quy định tại Nghị định số 84/2007/NĐ-CP. UBND huyện Hoài Đức thực hiện việc bồi thường, hỗ trợ giải phóng mặt bằng theo diện tích ghi trên giấy tờ về quyền sử dụng đất, không căn cứ vào diện tích đo đạc thực tế là không đúng với quy định của Nghị định số 84/2007/NĐ-CP.
Tại thời điểm thanh tra, diện tích đất của dự án được bàn giao là 136,48 ha đất, giảm 1,68 ha so với diện tích đất được giao tại Quyết định số 1174/QĐ-UBND ngày 8/5/2008 của UBND tỉnh Hà Tây nhưng chủ đầu tư dự án là Tổng Công ty Cổ phần Thương mại Xây dựng (Vietracimex) và UBND huyện Hoài Đức chưa chủ động hoàn thiện hồ sơ để trình UBND TP Hà Nội điều chỉnh lại diện tích đất giao cho Vietracimex; chưa bàn giao đất theo quy định đối với 10,28 ha đất là chưa nỗ lực thực hiện, gây khó khăn cho việc sử dụng đất của dự án.
Về giao đất, nộp tiền sử dụng đất, theo kết luận thanh tra, UBND tỉnh Hà Tây có Quyết định số 1174/QĐ-UBND về việc thu hồi 138,17 ha đất, giao Vietracimex thực hiện dự án nhưng không quy định cụ thể diện tích đất giao có thu tiền sử dụng đất, cho thuê đất, thời hạn sử dung đất…. để làm căn cứ cho việc xác định tiền sử dụng đất, không căn cứ vào Quy hoạch chi tiết xây dựng tỷ lệ 1/500 đã được duyệt là thực hiện không đúng quy định tại Nghị định số 181/2004/NĐ-CP. Trước khi ra quyết định giao đất cho Vietracimex, Sở Tài nguyên và Môi trường tỉnh Hà Tây không thẩm định nhu cầu dử dụng đất của dự án là thực hiện không đúng quy định của Nghị định số 181/NĐ-CP. UBND tỉnh Hà Tây có Quyết định số 1381/QĐ-UBND ngày 27/5/2008 về việc phê duyệt tiền sử dụng đất của dự án đối với 53,9 ha đất (bao gồm đất nhà liền kề, biệt thự, chung cư cao tầng và đất công trình hỗn hợp) theo Quyết định số 1256/QĐ-UBND của UBND tỉnh Hà Tây là chưa đung quy định tại Nghị định số 198/2004/NĐ-CP và Thông tư số 117/2004/TT-BTC của Bộ Tài chính.
Các sở, ngành chức năng, UBND TP Hà Nội chưa kiểm tra, xem xét, tính toán cụ thể để báo cáo Thủ tướng Chính phủ quyết định việc áp dụng chi phí rủi ro bất động sản và chi phí bảo dưỡng hạ tầng không đúng quy định trong quá trình xác định tiền sử dụng đất của dự án với số tiền 89,3 tỷ đồng theo Kết luận thanh tra số 2351 ngày 17/9/2012 của Thanh tra Chính phủ là chưa thực hiện đúng chỉ đạo của Thủ tướng Chính phủ. Vietracimex ký hợp đồng chuyển nhượng đất, nhà cho 16 khách hàng khi dự án chưa đủ điều kiện chuyển nhượng.
Trước vi phạm nêu trên, Thanh tra Chính phủ đã đề nghị UBND TP Hà Nội chỉ đạo kiểm điểm nghiêm túc, xác định rõ trách nhiệm theo quy định đối với cá nhân, tập thể do thực hiện chưa đúng quy định của pháp luật để xảy ra một số thiếu sót, tồn tại; chỉ đạo UBND huyện Hoài Đức khẩn trương hoàn thành công tác giải phóng mặt bằng, bàn giao để Vietracimex triển khai thực hiện dự án theo Điều chỉnh tổng thể Quy hoạch chi tiết tỉ lệ 1/500 được duyệt, tránh gây lãng phí đất đai.
Phối hợp với Vietracimex rà soát, xác định số tiền hơn 20 tỷ đồng mà Vietracimex đã chi trả, hỗ trợ di chuyển mộ chí cho đối tượng bị thu hồi đất để thực hiện dự án, lập phương án bồi thường, hỗ trợ, giải phóng mặt bằng theo quy định; khắc phục những sai sót trong công tác giải phóng mặt bằng.
Chỉ đạo các sở, ngành chức năng kiểm tra, rà soát việc đền bù không theo diện tích đất sử dụng thực tế, báo cáo UBND TP Hà Nội biện pháp khắc phục, đảm bảo ổn định tình hình an ninh, chính trị ở địa phương, không làm phát sinh khiếu kiện phức tạp.
Chỉ đạo các cơ quan liên quan và Vietracimex khẩn trương rà soát, thực hiện các thủ tục xác định và thu nộp nghĩa vụ tài chính của dự án, đảm bảo thu đúng, thu đủ vào ngân sách nhà nước theo quy định.
Lập đoàn kiểm tra thực hiện kết luận thanh tra các dự án bỏ hoang 
Công bố kết luận thanh tra đối với UBND TP Hồ Chí Minh 
